ABSTRAKT

ribozomální peptidyl transferase center (PTC) je umístěn ve velké ribozomální podjednotky a katalyzuje dvě hlavní chemické reakce syntézy proteinů: tvorba peptidové vazby-vznik a uvolnění peptidu. Použité katalytické mechanismy a jejich inhibice antibiotiky jsou v centru pozornosti molekulárních a strukturálních biologů po celá desetiletí. S objasnění atomové struktury velké ribozomální podjednotky na úsvitu nového tisíciletí, tyto otázky získal novou úroveň molekulární význam. Krystalografické struktury přesvědčivě potvrdily, že peptidyltransferáza je enzym RNA. To řadí ribozom na seznam přirozeně se vyskytujících riboyzmů, které přežily přechod od pre-biotického RNA světa k současné biologii. Biochemické, genetické a strukturální důkazy zdůrazňují roli ribozomu jako entropického katalyzátoru, který urychluje tvorbu peptidové vazby primárně polohováním substrátu. Současně by uvolňování peptidů mělo silněji záviset na chemické katalýze, která pravděpodobně zahrnuje rRNA skupinu PTC. PTC se vyznačuje nejvýraznější akumulací univerzálně konzervovaných rRNA nukleotidů v celém ribozomu. Proto bylo překvapením, že nedávná zjištění odhalila neočekávanou vysokou úroveň variací v režimu vazby antibiotik na PTC ribozomů z různých organismů.