abstrakt

det ribosomale peptidyltransferase center (PTC) ligger i den store ribosomale underenhed og katalyserer de to vigtigste kemiske reaktioner ved proteinsyntese: dannelse af peptidbindinger og frigivelse af peptid. De anvendte katalytiske mekanismer og deres hæmning af antibiotika har været i fokus for molekylære og strukturelle biologer i årtier. Med belysningen af atomstrukturer i den store ribosomale underenhed ved begyndelsen af det nye årtusinde fik disse spørgsmål et nyt niveau af molekylær betydning. De krystallografiske strukturer bekræftede overbevisende, at peptidyltransferase er et RNA. Dette placerer ribosomet på listen over naturligt forekommende riboysmer, der overlevede overgangen fra den præbiotiske RNA-verden til nutidig biologi. Biokemiske, genetiske og strukturelle beviser fremhæver ribosomets rolle som en entropisk katalysator, der fremskynder dannelsen af peptidbindinger primært ved substratpositionering. Samtidig bør peptidfrigivelse stærkere afhænge af kemisk katalyse, der sandsynligvis involverer en rRNA-gruppe af PTC. PTC er kendetegnet ved den mest udtalte ophobning af universelt konserverede rRNA-nukleotider i hele ribosomet. Således kom det som en overraskelse, at nylige fund afslørede et uventet højt niveau af variation i tilstanden af antibiotikabinding til PTC af ribosomer fra forskellige organismer.