Adso van Melk vertelt hoe hij in 1327, als jonge Franciscaanse novice (een benedictijn in de roman), samen met zijn mentor, Franciscaanse broeder Willem van Baskerville, naar een Benedictijnse abdij in Noord-Italië reisde, waar de Franciscanen met pauselijke afgezanten de armoede van Christus zouden bespreken. De abdij heeft een beroemd scriptorium waar schriftgeleerden boeken kopiëren, vertalen of verlichten. De monnik Adelmo van Otranto – een jonge maar beroemde manuscript illuminator-werd verdacht dood gevonden op een heuvel onder een toren met alleen een raam dat niet kan worden geopend. De abt zoekt hulp bij Willem, die bekend staat om zijn deductieve krachten. William wordt met tegenzin aangetrokken door de intellectuele uitdaging en zijn verlangen om de angsten van een demonische boosdoener te weerleggen. Willem maakt zich ook zorgen dat de abt ambtenaren van de Inquisitie zal oproepen als het mysterie onopgelost blijft.William leidt al snel af dat Adelmo zelfmoord pleegde door uit een nabijgelegen toren te springen met een raam, en dat de helling van de heuvel ervoor zorgde dat het lichaam onder de andere toren rolde. Willems oplossing verzacht kort de angsten van de monniken, totdat een andere monnik dood wordt gevonden, onheilspellend drijvend in een vat met varkensbloed. Het slachtoffer is Venantius, een vertaler van het Grieks en de laatste man die met Adelmo sprak. Het lijk draagt zwarte vlekken op een vinger en de tong. De dood van de vertaler wakkert de angst van de monniken aan voor een bovennatuurlijke boosdoener, angsten versterkt wanneer de Heilige Fransciscaner broeder Ubertino van Casale waarschuwt dat de doden lijken op tekenen die in het boek Openbaring worden genoemd. In het scriptorium inspecteert William Adelmo ‘ s bureau, maar wordt geblokkeerd door broeder Berengar, de assistent-bibliothecaris. Broeder Malachia, de hoofdbibliothecaris, ontzegt William de toegang tot de rest van het gebouw.William ontmoet Salvatore, een demente gebochelde, en zijn beschermer, Remigio da Varagine, de keldermeester. Willem leidt hieruit af dat beiden Dulcinieten waren, leden van een ketterse, militante sekte die gelooft dat de geestelijkheid verarmd moet worden. Willem verdenkt hen echter niet van moord omdat Dulcinieten zich richten op rijke bisschoppen, niet op arme monniken. Toch geeft Remigio ‘ s verleden Willem een hefboom om de geheimen van de abdij te leren kennen. Salvatore vertelt Willem dat Adelmo Venantius had ontmoet op de avond dat Adelmo stierf. Ondertussen ontmoet Adso een mooi, semi-wild boerenmeisje dat de abdij is binnengeslopen om seksuele gunsten te ruilen voor voedsel, en door haar wordt verleid.toen hij die avond terugkeerde naar Venantius ‘ bureau, vond Willem een boek in het Grieks, en een perkament met Grieks schrift, vlekken van een kleur gemengd door Adelmo voor het verlichten van boeken, en cryptische symbolen geschreven door een linkshandige man met behulp van onzichtbare inkt. Berengar sluipt het donkere scriptorium binnen, leidt William af en steelt het boek.

Berengar is later verdronken in een bad en heeft dezelfde vlekken als op Venantius. William vertelt zijn conclusies dat Adelmo ‘ s dood inderdaad zelfmoord was, als gevolg van het toegeven aan berengars verzoeken om homoseksuele gunsten. Venantius ontving een perkament van Adelmo voor Adelmo ‘ s dood, en Berengar is de enige linkshandige man in de abdij. William theoretiseert dat de vertaler de Griekse aantekeningen op het perkament van een boek heeft getranscribeerd, en dat het Boek op de een of andere manier verantwoordelijk is voor de doden. De abt is niet overtuigd en, terwijl hij het perkament verbrandt, informeert hij Willem dat de Inquisitie — in de persoon van Bernardo Gui, een oude tegenstander van Willem uit zijn vroegere tijd als inquisiteur — al is opgeroepen.

vastbesloten om het mysterie op te lossen voordat Gui arriveert, ontdekken William en Adso een enorme, verborgen bibliotheek boven het scriptorium. William vermoedt dat de abdij de boeken verborg omdat veel van hun inhoud afkomstig is van heidense filosofen. GUI vindt Salvatore en het boerenmeisje vechten om een zwarte haan terwijl in de aanwezigheid van een zwarte kat. Voor Gui is dit onweerlegbaar bewijs van hekserij, en hij martelt Salvatore tot een valse bekentenis. Als zowel Willems Franciscaner broers als de pauselijke afgevaardigden arriveren, begint het debat. De kruidendokter van de abdij, nadat hij Willem heeft verteld dat hij een boek in het Grieks heeft gevonden in zijn apotheek, wordt vermoord door wat naar verluidt Malachia is. De laatste trucs Remigio in een poging om te ontsnappen, waardoor hij wordt gearresteerd door GUI ‘ s bewakers en beschuldigd van de moorden.Remigio, Salvatore en het meisje worden voor een rechtbank gebracht. GUI kiest hem om zich bij de abt aan te sluiten als rechter voor het tribunaal. Tijdens het proces geeft Remigio trots zijn Dulcinitische verleden toe en onder GUI ‘ s dreigementen van marteling bekent hij ook valselijk de moorden. Willem wijst erop dat de moorden verbonden zijn met het Griekse boek, dat Remigio niet kon lezen, en waarschuwt dat Remigio ‘ s executie de moorden niet zal beëindigen. Gui zorgt ervoor dat de gevangenen op de brandstapel worden verbrand, terwijl Willem naar Avignon wordt gebracht. De pauselijke afgevaardigden veroordelen de Franciscanen voor Willems koppigheid en beëindigen het debat.terwijl de monniken zich voorbereiden om GUI ‘ s gevangenen te verbranden, wordt Malachia dood aangetroffen, met zwarte vlekken op zijn tong en vinger. Hoewel Malachia ‘ s dood Willems waarschuwing rechtvaardigt, neemt Gui het als bewijs dat Willem de moordenaar is, en beveelt zijn arrestatie. Op de vlucht voor Gui ‘ s bewakers, gaan Willem en Adso opnieuw de geheime bibliotheek binnen en komen oog in oog te staan met de blinde eerbiedwaardige Jorge, de oudste bewoner van de abdij. Na het ontcijferen van de regels op het perkament van de vertaler, eist William dat Jorge het boek dat the dead men had gelezen uitlezen: Aristoteles ‘ tweede boek van poëtica over komedie. Jorge haat lachen, denkend dat het het geloof in God ondermijnt, en een boek over lachen geschreven door Arisotle zal alleen maar gelach brengen aan de Wijzen, en ondermijnt het geloof onder degenen die leren. Om dat te voorkomen, doodde Jorge degenen die het boek hadden gelezen door de pagina ‘ s ervan te vergiftigen. Jorge geeft het boek aan William, denkend dat hij ook het GIF zal ondergaan. Wanneer William onthult dat hij handschoenen draagt, pakt Jorge het boek en begint dan een brand die snel de bibliotheek overspoelt. William blijft achter, probeert een aantal van de boeken te redden en moedigt Adso aan om te vertrekken. Jorge pleegt zelfmoord door de met gif bedekte pagina ‘ s te consumeren.toen ze het vuur zagen, lieten de monniken de gevangenen in de steek, waardoor de lokale boeren het meisje konden redden, hoewel Salvatore en Remigio stierven. Adso achtervolgt Gui, die erin slaagt om hem te ontsnappen, maar de boeren duwen zijn wagen van een klif, spietsen hem. Als William en Adso vertrekken, ontmoet Adso het meisje, stopt voor een paar seconden, maar uiteindelijk kiest hij ervoor om met William te gaan. De veel oudere Adso zegt dat hij nooit spijt van zijn beslissing als hij veel meer dingen geleerd van Willem voordat hun wegen scheidden. Hij zegt ook dat het meisje was de enige aardse liefde van zijn leven, maar hij nooit haar naam geleerd.