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Frederick Soddy, der Sohn von Benjamin Soddy, einem Londoner Kaufmann, wurde am 2. September 1877 in Eastbourne, Sussex, England, geboren. Er studierte am Eastbourne College und am University College of Wales in Aberystwyth.1895 erhielt er ein Stipendium am Merton College in Oxford, das er 1898 mit First class Honours in Chemie abschloss. Nach zwei Jahren der Forschung in Oxford ging er nach Kanada und von 1900 bis 1902 war Demonstrator in der Chemie-Abteilung der McGill University, Montreal. Hier arbeitete er mit Professor Sir Ernest Rutherford an Problemen der Radioaktivität. Zusammen veröffentlichten sie eine Reihe von Arbeiten zur Radioaktivität und kamen zu dem Schluss, dass es sich um ein Phänomen handelt, bei dem atomare Zersetzung mit der Bildung neuer Arten von Materie einhergeht. Sie untersuchten auch die gasförmige Emission von Radium.Soddy verließ Kanada und arbeitete dann mit Sir William Ramsay am University College in London, wo er das Studium der Radiumemanation fortsetzte. Hier konnten Soddy und Ramsay spektroskopisch nachweisen, dass das Element Helium beim radioaktiven Zerfall einer Probe von Radiumbromid erzeugt wurde und dass Helium beim Zerfall der Emanation entwickelt wurde.Von 1904 bis 1914 war Soddy Dozent für Physikalische Chemie und Radioaktivität an der Universität Glasgow. Hier hat er viel praktische chemische Arbeit an radioaktiven Stoffen. Während dieser Zeit entwickelte er das sogenannte „Verschiebungsgesetz“, nämlich dass die Emission eines Alphateilchens von einem Element bewirkt, dass sich dieses Element im Periodensystem um zwei Stellen zurückbewegt. Sein Höhepunkt wurde 1913 mit seiner Formulierung des Konzepts der Isotope erreicht, wonach bestimmte Elemente in zwei oder mehr Formen existieren, die unterschiedliche Atomgewichte haben, aber chemisch nicht unterscheidbar sind.
1914 wurde er zum Professor für Chemie an der University of Aberdeen ernannt, aber die Forschungspläne wurden durch den Krieg behindert. 1919 wurde er Dr. Lees Professor für Chemie an der Universität Oxford, ein Posten, den er bis 1937 innehatte, als er nach dem Tod seiner Frau in den Ruhestand ging.
Nach seiner Zeit in Glasgow beschäftigte er sich nicht mehr mit Radioaktivität. Sein Interesse wechselte zu wirtschaftlichen, sozialen und politischen Theorien, die zu dieser Zeit keine allgemeine Akzeptanz fanden, und zu ungewöhnlichen mathematischen und mechanischen Problemen.Zu seinen Büchern gehören Radioaktivität (1904), Die Interpretation von Radium (1909), Die Chemie der radioaktiven Elemente (1912-1914), Materie und Energie (1912), Wissenschaft und Leben (1920), Die Interpretation des Atoms (1932), Die Geschichte der Atomenergie (1949) und atomare Transmutation (1953).Soddy wurde 1910 zum Fellow der Royal Society gewählt und Oxford verlieh ihm den Ehrentitel. 1951 erhielt er die Albert-Medaille.
Er war ein Mann mit starken Prinzipien und hartnäckigen Ansichten, freundlich zu Studenten und stachelig zu Kollegen.1908 heiratete er Winifred Beilby. Er starb am 22.September 1956 in Brighton.