El Centro de Peptidil Transferasa Ribosomal: Estructura, Función, Evolución, Inhibición
RESUMEN
El centro de peptidil transferasa ribosomal (PTC) reside en la gran subunidad ribosomal y cataliza las dos reacciones químicas principales de la síntesis de proteínas: formación de enlaces peptídicos y liberación de péptidos. Los mecanismos catalíticos empleados y su inhibición por los antibióticos han estado en el foco de los biólogos moleculares y estructurales durante décadas. Con la elucidación de las estructuras atómicas de la gran subunidad ribosómica en los albores del nuevo milenio, estas preguntas adquirieron un nuevo nivel de importancia molecular. Las estructuras cristalográficas confirmaron de manera convincente que la peptidil transferasa es una enzima ARN. Esto coloca al ribosoma en la lista de riboizmas naturales que sobrevivieron a la transición del Mundo del ARN pre-biótico a la biología contemporánea. La evidencia bioquímica, genética y estructural destaca el papel del ribosoma como catalizador entrópico que acelera la formación de enlaces peptídicos principalmente por el posicionamiento del sustrato. Al mismo tiempo, la liberación de péptidos debe depender más fuertemente de la catálisis química que probablemente involucre a un grupo de ARNr del PTC. El PTC se caracteriza por la acumulación más pronunciada de nucleótidos de ARNr universalmente conservados en todo el ribosoma. Por lo tanto, fue una sorpresa que los hallazgos recientes revelaran un alto nivel inesperado de variación en el modo de unión de antibióticos al PTC de los ribosomas de diferentes organismos.