En 1986, Tomac tomó dos decisiones importantes: se trasladó al sur de California, y dejó la competición de BMX en favor de las carreras de bicicleta de montaña. Continuó cabalgando hacia Mangosta. Para el otoño de ese año, había ganado sus dos primeros eventos importantes de bicicleta de montaña: la Carrera por etapas Ross Fat Tire en Massachusetts y la carrera de Exhibición de Bicicleta de Montaña Supercross celebrada en el Coliseo Memorial de Los Ángeles. Mangoose comercializó un modelo Tomac Signature Edition en 1987, que reflejaba su creciente perfil dentro de la cultura del ciclismo de montaña. Tomac logró algunas victorias más notables durante ese año, incluida una segunda victoria en la Carrera por etapas de Fat Tire y tres rondas de la Serie Nacional de XC.

En 1987, John Tomac apareció en uno de los primeros videos instructivos de ciclismo de montaña producidos, titulado El Gran Video de Ciclismo de Montaña producido por New & Videos únicos de San Diego, California.

John Tomac Aparece en «The Great Mountain Biking Video» 1987, Big Bear Lakes, California – Foto de Patty Mooney

Ned Overend, John Tomac y Tinker Juárez Compiten en el Cindy Whitehead Desert Classic, Palm Springs, California, 1989-Foto de Patty Mooney

1988 trajo a Tomac el éxito ganador del título nacional. Al lograr el total de puntos combinados más alto de los campeonatos de Esquí de Fondo, Descenso y Eslalon Dual de la Asociación Nacional de Bicicletas Todoterreno (NORBA), Tomac ganó el título general de Campeón del Mundo de NORBA. Fue clasificado en el primer lugar en las disciplinas de Cross-country y Dual Slalom. El estatus de «Mundial» era un nombre inapropiado, sin embargo, ya que los campeonatos de NORBA se celebraron solo en los Estados Unidos. El primer verdadero Campeonato Mundial de XC y DH, sancionado por la Unión Ciclista Internacional, se celebró en Durango, Colorado, en 1990, donde John se ubicó en el cuarto lugar en el descenso. John es muy recordado por montar barras de descenso estilo carretera en su bicicleta de montaña Yeti en esta carrera, que fue una desviación notable de los otros corredores. Esta decisión de equipamiento fue influenciada por su experiencia reciente en el equipo de ciclismo de carretera 7-11 en Europa, donde estaba bajo contrato. Los resultados de Tomac y su rápido ascenso a la fama le valieron el reconocimiento de la revista de ciclismo estadounidense Velo News, que lo votó como el mejor ciclista del mundo de 1988.

Tomac retuvo su título general de NORBA en 1989, y también ganó el Campeonato NORBA DH por primera vez. En una temporada en la que compitió al más alto nivel a ambos lados del Atlántico, añadió los títulos de XC alemanes y europeos a su colección. En 1990, se unió al equipo de MTB de fábrica de Yeti Cycles y al equipo de carretera 7-11, embarcándose en un ajetreado programa de eventos en Europa y Estados Unidos Para facilitar su carrera en carreras de carretera, Tomac se estableció en Bélgica y viajó regularmente entre los dos continentes para competir en grandes eventos de carretera y montaña. Aunque no pudo ganar ninguna de las tres series individuales de NORBA, ganó el título general de NORBA por tercer año consecutivo.

1991 vio un cambio de equipos: de Yeti a Raleigh y de 7-11 a Motorola. Una temporada de ciclismo de montaña más fuerte culminó con el éxito del Campeonato Mundial de la UCI en Ciocco, Italia, con Oro en XC y Plata en DH. Además de eso, Tomac ganó dos eventos en su camino al título de la Copa del Mundo de XC de la UCI, y agregó un segundo título de NORBA DH a su victoria en 1989. Al año siguiente, terminó en quinto lugar en el Campeonato Mundial de DH celebrado en Bromont, Canadá, y tuvo que conformarse con el segundo lugar detrás del suizo Thomas Frischknecht en el ranking de la Copa Mundial de XC (aunque hubo dos victorias en eventos de nuevo). Un accidente en el que Tomac golpeó a un espectador errante en el evento final en Mount Snow, Vermont, le impidió superar a su rival y retener el título.

En 1993, Tomac fue subcampeón tras el alemán Jürgen Beneke en la Copa del Mundo de Descenso UCI inaugural y perdió ante Frischknecht de nuevo en el ranking de XC. Esta iba a ser la última temporada en la que Tomac terminaría entre los tres primeros en la Copa del Mundo, pero continuó logrando resultados notables en los Campeonatos del Mundo. En 1997, cinco años después de su última medalla en el Campeonato del Mundo, terminó segundo en el evento de descenso en Château-d’Oex en Suiza.

Entre 1994 y 1997, Tomac ganaría tres títulos más de NORBA, dos en DH y uno en XC, así como algunos eventos individuales notables como Sea Otter Classic y Cactus Cup. Anunció oficialmente su retiro de las carreras en el Sea Otter Classic en el año 2000, pero más tarde volvería ocasionalmente a la competición. En 2004, a la edad de 37 años, ganó el famoso Kamikaze Downhill celebrado en Mammoth Mountain, California. Luego, por si acaso, regresó en 2005 y ganó de nuevo.