Samuel Butler nació en Strensham, Worcestershire, y era el hijo de un granjero y capillero, también llamado Samuel. Se desconoce su fecha de nacimiento, pero hay pruebas documentales de la fecha de su bautismo, el 14 de febrero. La fecha del bautismo de Butler es el 8 de febrero por Treadway Russell Nash en su edición de 1793 de Hudibras. Nash ya había mencionado a Butler en sus Colecciones para a History of Worcestershire (1781), y tal vez debido a que la última fecha parecía ser un relato revisado, ha sido repetida por muchos escritores y editores. Sin embargo, el registro parroquial de Strensham registra bajo el año 1612: «Item fue bautizado Samuell Butler el sonne de Samuell Butler el xiii de febrero anno ut supra». El Día de la Dama, el 25 de marzo, era el Día de Año Nuevo en Inglaterra en ese momento, por lo que el año de su bautismo fue 1613 de acuerdo con el cambio del comienzo del año con la Ley del Calendario de 1750 (ver fechas de Estilo Antiguo y Estilo Nuevo). Nash también afirma en su edición de 1793 de Hudibras que el padre de Butler anotó el bautismo de su hijo en el registro, un error que también se repitió en publicaciones posteriores; sin embargo, la entrada fue claramente escrita por una mano diferente.

Butler se crió en la casa de Sir William Russell de Strensham y se convirtió en su empleado. «Cuando era un niño, hacía observaciones y reflexiones sobre cada Cosa que uno decía o hacía, y lo censuraba para que estuviera bien o enfermo. Nunca estuvo en la Universidad por la razón alegada. Fue educado en la King’s School, Worcester, con Henry Bright, cuya enseñanza está registrada favorablemente por Thomas Fuller, un escritor contemporáneo, en su obra Worthies of England. En su juventud temprana fue un sirviente de la condesa de Kent. A través de Lady Kent conoció a su mayordomo, el jurista John Selden, quien influyó en sus escritos posteriores. También intentó pintar, pero al parecer no era muy bueno en eso; uno de sus editores informó que «sus fotos servían para detener las ventanas y ahorrar el impuesto» (en el vidrio de la ventana). Por el contrario, John Aubrey, que conocía a Butler lo suficientemente bien como para ser uno de sus portadores del féretro, escribió que «Una vez pensó en hacer de la pintura su Profesión. Su amor y habilidad en la pintura hicieron una gran amistad entre él y el Sr. Samuel Cowper (El Príncipe de los Limner de esta Época.»Estudió derecho, pero no ejerció.

Después de la Restauración, se convirtió en secretario, o mayordomo, de Richard Vaughan, segundo Conde de Carbery, Lord Presidente de Gales, lo que implicó vivir al menos un año en Ludlow, Shropshire, hasta enero de 1662, mientras pagaba a los artesanos que trabajaban en la reparación del castillo allí. A finales de 1662 se publicó la primera parte de Hudibras, que comenzó a escribir cuando se alojaba en Holborn, Londres, en 1658 y continuó trabajando mientras estaba en Ludlow, y las otras dos en 1664 y 1678, respectivamente. Uno de los primeros compradores de las dos primeras partes fue Samuel Pepys. Si bien el cronista reconoció que el libro era la «mejor moda», no podía ver por qué se encontró que era tan ingenioso.

A pesar de la popularidad de Hudibras, a Butler no se le ofreció un lugar en la Corte. «Los sabios satíricos disobligan con quién conversan y, en consecuencia, se hacen muchos Enemigos y pocos Amigos; y este era su modo y su caso. Sin embargo, se cree que Butler estuvo al servicio del duque de Buckingham en el verano de 1670, y lo acompañó en una misión diplomática a Francia. Butler también recibió apoyo financiero en forma de una subvención del rey Carlos II.

Durante la última parte de su vida, Butler vivió en una casa en la ahora parcialmente demolida calle Rose, al oeste de Covent Garden.Butler murió de consumo el 25 de septiembre de 1680, y fue enterrado el 27 de septiembre en el patio de la Iglesia de St.Paul, Covent Garden; en la parte norte junto a la iglesia en el extremo este. «Sus pies tocan la pared. Su tumba a 2 yardas de la Pilastra del Dore (por su deseo) a 6 pies de profundidad» a expensas de un Sr. Longueville, aunque no estaba endeudado cuando murió. Aubrey en Vidas breves describe su tumba como » estar en la parte norte junto a la iglesia en el extremo este … 2 yardas de distancia de la pilastra del dore». También, un monumento en su honor fue colocado en la Abadía de Westminster en 1732 por un impresor, John Barber, y el Alcalde de Londres. También hay una placa conmemorativa en su honor en la pequeña iglesia del pueblo de Strensham, Worcestershire, cerca de la ciudad de Upton upon Severn, su lugar de nacimiento.