La taxonomía es la ciencia que explora, describe, nombra y clasifica a todos los organismos. En este capítulo introductorio, destacamos los principales pasos históricos en la elaboración de esta ciencia que proporciona datos de referencia para todos los campos de la biología y desempeña un papel vital para la sociedad, pero también es una disciplina científica independiente, compleja y basada en hipótesis sólidas.En una primera parte, subrayamos que la taxonomía vegetal es una de las disciplinas científicas más tempranas que surgieron hace miles de años, incluso antes de las importantes contribuciones de griegos y romanos (por ejemplo, Teofrasto, Plinio el Viejo y Dioscórides). En los siglos XV al XVI, la taxonomía vegetal se benefició de las Grandes Navegaciones, la invención de la imprenta, la creación de jardines botánicos y el uso de la técnica de secado para preservar especímenes de plantas. En paralelo con el creciente cuerpo de datos morfo-anatómicos, los pasos importantes posteriores en la historia de la taxonomía de las plantas incluyen el surgimiento del concepto de clasificación natural, la adopción del sistema de nomenclatura binomial (con el papel principal de Linneo) y otras reglas universales para la nomenclatura de las plantas, la formulación del principio de subordinación de los caracteres y el advenimiento del pensamiento evolutivo. Más recientemente, la teoría cladística (iniciada por Hennig) y los rápidos avances en las tecnologías de ADN permitieron inferir filogenias y proponer verdaderas genealogías naturales classifications.In una segunda parte, ponemos el énfasis en los desafíos que enfrenta la taxonomía vegetal en la actualidad. El conocimiento taxonómico aún muy incompleto de la flora mundial (el llamado impedimento taxonómico) está obstaculizando seriamente los esfuerzos de conservación que son especialmente cruciales a medida que la biodiversidad entra en su sexta crisis de extinción. Parece deberse principalmente a una financiación insuficiente, a la falta de conocimientos taxonómicos y a la falta de comunicación y coordinación. A continuación, revisamos las iniciativas recientes para superar estas limitaciones y anticipar cómo debería y podría evolucionar la taxonomía. En particular, el uso de datos moleculares ha sido una división de épocas para la taxonomía y puede permitir un ritmo acelerado de descubrimiento de especies. Examinamos las fortalezas y limitaciones de estas técnicas en comparación con las investigaciones basadas en la morfología, damos recomendaciones amplias sobre el uso de herramientas moleculares para la taxonomía de plantas y destacamos la necesidad de una taxonomía integradora basada en evidencia de múltiples fuentes.