Kessler on National Comorbidity Surveyn (NCS) Päätutkija. NCS oli ensimmäinen kansallisesti edustava tutkimus psykiatristen häiriöiden yleisyydestä ja korrelaateista Yhdysvalloissa. Tutkimus toteutettiin vuosina 1991 ja 1992.

hän on myös Päätutkija useissa NCS: n laajennuksissa, mukaan lukien 10 vuoden seuranta NCS: n perusnäytteestä ja replikointi NCS: stä vuosina 2001 ja 2002 tutkiakseen muutoksia mielenterveydessä ja mielenterveyshäiriöiden hoidossa Yhdysvalloissa 1990-luvun vuosikymmenen aikana.

hän myös kodifioi Maailman terveysjärjestön World Mental Health (WMH) surveys-tutkimuksen, joka on sarja kansallisesti edustavia epidemiologisia tutkimuksia, joita on tehty 28 maassa ja joiden yhteenlaskettu otoskoko oli yli 200 000 vastaajaa. World Mental Healthin toteuttamien kyselyiden tarkoituksena on tarjota hallitussuunnittelijoille tietoa, joka auttaa ohjaamaan investointeja mielenterveyshuoltoon.

hän on mukana suunnittelemassa ja toteuttamassa useita kokeellisia työpaikkainterventioita Yhdysvalloissa, Latinalaisessa Amerikassa ja Aasiassa, joiden tarkoituksena on määrittää erilaisten työpaikkatautien hallintaohjelmien kustannustehokkuus työnantajan näkökulmasta. Hän on myös mukana suunnittelemassa, toteuttamassa ja arvioimassa interventio-ohjelmien pitkäaikaisia vaikutuksia tunneperäisistä ongelmista kärsiville nuorille. Hän johtaa myös Hurricane Katrina Community Advisory Group-paneelitutkimusta psykologisesta sopeutumisesta niiden ihmisten keskuudessa, jotka olivat hurrikaani Katrinan vaikutuspiirissä myrskyn aikaan.

hänen tämänhetkiseen tutkimukseensa kuuluu NCS adolescent (NCS-a) – tutkimus, joka on ensimmäinen nuorten mielenterveyttä koskeva kansallisesti edustava tutkimus, joka on koskaan tehty Yhdysvalloissa. Mukana on yli 10 000 nuorta vanhempineen ja opettajineen.