serotonerginen järjestelmä on yksi vanhimmista aivojen amiinijärjestelmistä. Se on myös yksi salaperäisimmistä. On hyvin vaikea sanoa muutamalla sanalla, mitä serotonerginen järjestelmä tekee. Se on lähtöisin kahdesta keskiaivojen alueesta, joita kutsutaan dorsal raphe ja mediaani raphe. Ne molemmat inervate etu-ja keskiaivojen rakenteita tavallaan toisiaan täydentävillä tavoilla, jotka ovat hieman monimutkaisia mennä. Serotoniinijärjestelmä vaikuttaa olevan vahvasti mukana estämisessä. Se vastustaa toiminnassaan useimpia muita amiinijärjestelmiä ja se on estävä sekä aistien syötön että käyttäytymisen ulostulon suhteen. LSD on lääke, joka toimii aivojen serotoniinireseptorien kautta.se tuottaa uskomattomia näköharhoja serotoniinireseptoreiden kanssa. Ulostulopuolella tiedetään, että serotoniini on hyvin paljon mukana impulsiivisuudessa eli ilman ennakointia tapahtuvassa käyttäytymisessä. Tiedämme omassa tutkimuksessamme rotilla, että jos rotilla on alhainen serotoniini, ne eivät yksinkertaisesti pysty hillitsemään itseään reagoimasta, kun niiden ei pitäisi. Ja ihmistermein sanottuna serotoniinin toiminta on yhdistetty myös esimerkiksi aggressioon. Alhainen serotoniini aiheuttaa käyttäytymishäiriöitä, jotka johtavat aggressioon.