kun Indira vaati vaaleja tammikuussa 1977, se hävisi Rae Bareillyn Raj Narainille, ja monien oppositioryhmien, kuten Kongressin (O) kanssa liittoutui pitkäaikaisten kilpailijoiden, alueellisten puolueiden ja kilpailevien ideologioiden ryhmittymien kanssa muodostaen Janata-puolueen. Se sai 356 paikkaa, lähes 2/3 enemmistöä, ja ensimmäistä kertaa itsenäistymisen jälkeen hallitsevan Kongressipuolueen valta-asema murtui. Morarji Desai nousi lopulta pääministeriksi, kun Jaiprakash Narayan valitsi hänet mieheksi, joka todennäköisimmin pitää koalition yhtenäisenä.

hän oli tuolloin 81-vuotias, mutta edelleen terve ja reipas, ilman mitään erityisiä vaivoja.

pääministeri
Desai johti hajanaista koalitiohallitusta, eikä siten saanut paljoakaan aikaan jatkuvien riitojen ja monien kiistojen vuoksi. Kun yksikään puolue ei ollut koalition johdossa, kilpailevat ryhmät kilpailivat Desain syrjäyttämisestä. Merkittävien kongressijohtajien, muun muassa Indira Gandhin, kiistellyt oikeudenkäynnit hätätilan aikaisista väärinkäytöksistä heikensivät hänen hallintonsa kohtaloa. Desai pyrki parantamaan suhteita naapuriin ja arkkiviholliseen Pakistaniin ja palautti normaalit suhteet Kiinaan, ensimmäistä kertaa sitten vuoden 1962 sodan. Hän piti yhteyttä Zia-ul-Haqiin ja solmi ystävälliset suhteet ja myös diplomaattisuhteet solmittiin uudelleen Kiinan kanssa. Hänen hallituksensa kumosi monia perustuslakiin hätätilan aikana tehtyjä muutoksia ja vaikeutti minkään tulevan hallituksen kansallisen hätätilan määräämistä.

Intian ensimmäisen ydinkokeen jälkeen vuonna 1974 Desai piti Intian ydinreaktorit hallussaan todeten, että ”niitä ei koskaan käytetä atomipommeihin, ja pidän huolen siitä, jos voin auttaa sitä”. Vuonna 1977 Carterin hallinto myi Intialle, raskasvettä ja uraania ydinreaktoreitaan varten, mutta vaati amerikkalaisten paikan päällä suorittamaa ydinmateriaalien tarkastusta. Desai kieltäytyi, koska piti Yhdysvaltain kantaa ristiriitaisena Oman ydinasearsenaalinsa valossa.

eläköityminen & kuolema vuonna 1979 Raj Narain ja Charan Singh vetäytyivät Janata-puolueesta pakottaen Desain eroamaan virastaan ja vetäytymään politiikasta 83-vuotiaana. Desai kampanjoi Janata-puolueen puolesta vuoden 1980 parlamenttivaaleissa vanhempana poliitikkona, mutta ei itse kiistänyt vaaleja.

eläkevuosinaan hän asui Bombayssa ja kuoli 99-vuotiaana. Hän oli saanut viimeisinä vuosinaan paljon kunniaa sukupolvensa vapaustaistelijana.

Kanti Desaita, Morarji Desain poikaa, arvosteltiin usein korruptoituneeksi ja isänsä nimen käyttämisestä vaikuttajana. Desain eläköitymisen aikana perhe häädettiin Mumbain ”Oceanea” – kompleksissa sijaitsevasta asunnostaan tuomari Chandrachudin antamalla oikeuden päätöksellä. Maharashtran silloinen pääministeri Sharad Pawar järjesti hänelle pysyvän Govt-asunnon Mumbaissa kuolemaansa saakka.

on outoa, mutta totta, että Morarji Desai muistetaan useimmiten Virtsahoidon puolustajana. Hän kertoi toimittaja Khushwant Singhille, että häntä neuvottiin kokeilemaan oman virtsan juomista nelikymppisenä paalujen (peräpukamien) parantamiseksi, ja hän sai heti tuloksia. Sen jälkeen hän jatkoi käytäntöä ja oli melko avoin siitä sanoen, että sinun ei pitäisi tehdä mitään, mitä häpeäisit.

Morarji Desai oli Mahatma Gandhin periaatteiden tiukka seuraaja ja moralisti.

Feudi R&AW Morarji Desai oli kuvannut Intian ulkoisen tiedustelupalvelun tutkimus-ja Analyysisiipeä (r&AW) Indira Gandhin pretoriaanikaartiksi ja oli luvannut lopettaa R&AW tultuaan pääministeri. Hän lakkautti suuren osan virastosta ja pienensi sen budjettia ja toimintaa. B. Raman, entinen R&AW: n terrorisminvastaisen osaston johtaja ja tunnettu turvallisuusanalyytikko, paljastaa, että vartioimattomana hetkenä Morarji Desai kertoi varomattomasti Pakistanin presidentille Zia ul-Haqille olevansa tietoinen Islamabadin ydinohjelmista.

on selvää, että Moshe Dayan lähetettiin neuvottelemaan Morarji Desain kanssa saadakseen luvan israelilaisille Säiliöaluksille, jotka voisivat laskeutua tankkaamaan ja nousta IAF: n tukikohdasta Gujratista tukemaan Israelin suunnittelemaa tehtävää, Pak: n ydinlaitosten tuhoamista, ja sitten se nousisi, kuten he olivat tehneet Osirakissa Irakissa. Dayan oli naamioitunut Sikhiläiseksi herrasmieheksi yksityisellä vierailulla tarkoitusta varten. Pyyntö hylättiin, eikä tehtävä toteutunut.

sosiaalipalvelu Morarji Desai oli todellinen Gandhilainen seuraaja, sosiaalityöntekijä, instituutioiden rakentaja ja suuri uudistaja. Hän oli Mahatma Gandhin perustaman Gujarat Vidyapithin yliopiston kansleri. Jo pääministerikaudellaan hänellä oli tapana käydä ja yöpyä Vidyapithissä lokakuun ajan. Hän havainnollisti yksinkertaisuutta ja kirjoitti postikortteja itse jo pääministerinä ollessaan. Sardar Patel määräsi hänet johtamaan Kairan piirin maanviljelijöiden kokouksia, jotka lopulta johtivat AMUL-Osuuskuntaliikkeen perustamiseen. Valtakaudellaan hän perui interventiot julkiseen jakelujärjestelmään ja säännöstelykaupat kirjaimellisesti menetettiin markkinoilta saatavien halvan sokerin ja öljyn takia.

virtsahoito
Morarji Desai oli virtsahoidon harjoittaja. Vuonna 1978 hän puhui Dan Ratherille 60 Minutes-ohjelmassa virtsahoidosta. Desain mukaan virtsahoito oli täydellinen lääketieteellinen ratkaisu niille miljoonille intialaisille, joilla ei ole varaa lääketieteelliseen hoitoon. Desai väitti juoneensa joka päivä tuopillisen omaa virtsaansa.