Le Centre de la Peptidyl Transférase Ribosomique: Structure, Fonction, Évolution, Inhibition
RÉSUMÉ
Le centre de la peptidyl transférase ribosomique (PTC) réside dans la grande sous-unité ribosomique et catalyse les deux principales réactions chimiques de la synthèse des protéines: formation de liaisons peptidiques et libération de peptides. Les mécanismes catalytiques utilisés et leur inhibition par les antibiotiques sont au centre des biologistes moléculaires et structuraux depuis des décennies. Avec l’élucidation des structures atomiques de la grande sous-unité ribosomique à l’aube du nouveau millénaire, ces questions ont acquis un nouveau niveau de signification moléculaire. Les structures cristallographiques ont confirmé de manière convaincante que la peptidyl transférase est une enzyme ARN. Cela place le ribosome sur la liste des riboyzmes naturels qui ont survécu à la transition du monde de l’ARN pré-biotique à la biologie contemporaine. Les preuves biochimiques, génétiques et structurelles mettent en évidence le rôle du ribosome en tant que catalyseur entropique qui accélère la formation de liaisons peptidiques principalement par positionnement du substrat. En même temps, la libération de peptides devrait dépendre plus fortement de la catalyse chimique impliquant probablement un groupe d’ARNr du PTC. Le PTC est caractérisé par l’accumulation la plus prononcée de nucléotides d’ARNr universellement conservés dans l’ensemble du ribosome. Ainsi, il a été surprenant que des découvertes récentes aient révélé un niveau élevé inattendu de variation du mode de liaison des antibiotiques au PTC des ribosomes de différents organismes.