Articles

a riboszomális peptidil-transzferáz központ: szerkezet, funkció, evolúció, gátlás

absztrakt

a riboszomális peptidil-transzferáz központ (PTC) a nagy riboszomális alegységben található, és katalizálja a fehérjeszintézis két fő kémiai reakcióját: peptidkötésképződés és peptid-felszabadulás. Az alkalmazott katalitikus mechanizmusok és azok antibiotikumok általi gátlása évtizedek óta a molekuláris és strukturális biológusok középpontjában áll. Az új évezred hajnalán a nagy riboszomális alegység atomszerkezeteinek tisztázásával ezek a kérdések új molekuláris szignifikanciát nyertek. A kristálytani struktúrák kényszerítően megerősítették, hogy a peptidil-transzferáz egy RNS enzim. Ez a riboszómát a természetben előforduló riboyzmák listájára helyezi, amelyek túlélték a pre-biotikus RNS világból a kortárs biológiába való átmenetet. A biokémiai, genetikai és szerkezeti bizonyítékok kiemelik a riboszóma entróp katalizátor szerepét, amely felgyorsítja a peptidkötés kialakulását elsősorban a szubsztrát pozicionálásával. Ugyanakkor a peptid felszabadulásának erősebben függnie kell a kémiai katalízistől, amely valószínűleg magában foglalja a PTC rRNS csoportját. A PTC-t az univerzálisan konzervált rRNS nukleotidok legszembetűnőbb felhalmozódása jellemzi az egész riboszómában. Így meglepő volt, hogy a legújabb eredmények váratlanul magas szintű variációt tártak fel a különböző organizmusokból származó riboszómák PTC-hez való kötődésének módjában.