Ez a cikk célja, hogy azonosítsa a modellszervezetek legfontosabb jellemzőit, amelyek a modern élettudományok sajátos modelljévé teszik őket: különösen, azzal érvelünk, hogy a “modellszervezet” kifejezés nem vonatkozik a kísérleti kutatás céljára használt összes szervezetre. Feltárjuk a kísérleti és modellszervezetek közötti különbségeket anyagi és episztemikus jellemzőik tekintetében, és azzal érvelünk, hogy alapvető fontosságú megkülönböztetni reprezentációs hatókörüket és Reprezentációs céljukat. Megvizsgáljuk azoknak a közösségeknek a jellemzőit is, amelyek ezt a kétféle modellt használják, beleértve kutatási céljaikat, fegyelmi hovatartozásukat és előnyben részesített gyakorlataikat annak bemutatására, hogy ezek hogyan járultak hozzá a modellszervezet konceptualizálásához. Arra a következtetésre jutunk, hogy a modellszervezetek az organizmusok egy speciális alcsoportja, amelyet szabványosítottak, hogy illeszkedjenek egy integratív és összehasonlító kutatási módhoz, és hogy világosan meg kell különböztetni a kísérleti organizmusok szélesebb osztályától. Ezen túlmenően azt állítjuk, hogy a modellszervezetek a modellek felhasználásával végzett kutatás egyedülálló és jellegzetesen biológiai módjának kulcselemei.