az eljárás azzal kezdődik, hogy az érdekes sejtek sejtlizátumát készítjük. Ez a lizátum poliszómákat, monoszómákat (amelyek egy mRNS-en található riboszómából állnak), a kicsi (40s az eukariótákban) és a nagy (60s az eukariótákban) riboszómális alegységeket, “szabad” mRNS-t és számos más oldható sejtkomponenst tartalmaz.

az eljárás folytatódik a folyamatos szacharóz gradiens folyamatosan változó sűrűségű centrifugacsőben. Az alkalmazott koncentrációkban (15-45% a példában) a szacharóz nem zavarja meg a riboszómák és az mRNS társulását. A gradiens 15% – os része a cső tetején van, míg a 45% – os rész a különböző sűrűségük miatt alul van.

a lizátum meghatározott mennyiségét (optikai sűrűséggel mérve) ezután óvatosan rétegezzük a cső gradiensének tetejére. A lizátum, annak ellenére, hogy nagy mennyiségű oldható anyagot tartalmaz, sokkal kevésbé sűrű, mint a 15% – os szacharóz, ezért külön rétegként tartható a cső tetején, ha ezt óvatosan végezzük.

a lizátum komponenseinek elválasztása érdekében a készítményt centrifugálásnak vetjük alá. Ez felgyorsítja a lizátum komponenseit a gravitációs erő sokszorosával, és így a gradiensen keresztül hajtja őket annak alapján, hogy az egyes komponensek milyen “nagyok”. A kicsi (40s) alegységek kevésbé haladnak a gradiensbe, mint a nagy (60s) alegységek. Az mRNS 80-as évek ribszómái tovább haladnak (vegye figyelembe, hogy az mRNS méretének a megtett távolsághoz való hozzájárulása nem jelentős). A 2 riboszómából álló poliszómák tovább haladnak, a 3 riboszómával rendelkező poliszómák tovább haladnak, és tovább. Az alkatrészek “méretét” S, a svedberg egység jelöli. Vegye figyelembe, hogy egy S = 10-13 másodperc, és hogy a “nagy” fogalma valójában túlegyszerűsítés.

centrifugálás után a cső tartalmát frakcióként gyűjtik össze a tetejétől (kisebb, lassabb utazás) az aljáig (nagyobb, gyorsabb utazás), és meghatározzák a frakciók optikai sűrűségét. Az első eltávolított frakciók nagy mennyiségű viszonylag kis molekulát tartalmaznak, például tRNS-eket, egyedi fehérjéket stb.