Il Cigno Isole furono scoperte da Cristoforo Colombo nel 1502, di nome e le Islas de las Pozas. Nel 18 ° secolo, furono ribattezzate le Isole Swan, dopo il capitano Swan, il capitano della Cygnet, che i pirati catturarono e costrinsero a unirsi a loro.

Gli imprenditori americani hanno iniziato a esportare il guano come fertilizzante negli 1840. La “Atlantic and Pacific Guano Company”, di proprietà americana, con sede a New York, è stata fondata negli 1840 e ha iniziato a esportare fertilizzanti, basati sul guano raccolto sulle isole Swan. Nel 1856, gli Stati Uniti apparentemente reclamarono le isole. Nell’aprile del 1857, John Valentine White rivendicò le isole, in virtù del Guano Islands Act; più tardi quell’anno, trasferì tutto l’interesse per queste isole a Charles Sterns, Joseph W. Fabens e Duff Green. Messers Sterns, Fabens e Green incorporarono la Atlantic and Pacific Guano Company, che emise 50.000 azioni al prezzo di each 100 ciascuna per una capitalizzazione totale di $5.000.000 nel 1858. La compagnia emise anche valuta, firmata da William H. Whitfield, in tagli da 25 cent, 50 cent e un dollaro il 1º giugno 1867, per facilitare il commercio sulle isole.

Successivamente, una società chimica acquistò le isole ma divenne insolvente. Il capitano Alonzo Adams vi navigò nel 1893 e prese possesso delle isole; nel 1904, assegnò la proprietà alla Swan Island Commercial Company. Quella società affittò parte di Great Swan Island alla United Fruit Company, che coltivò palme da cocco e istituì una stazione di relè radio wireless per la manutenzione della loro flotta caraibica, ma alla fine abbandonò il contratto di locazione. La Swan Island Commercial Company ha fornito dati di monitoraggio degli uragani dal 1928 al 1932. L’U. S. Weather Bureau ha gestito una stazione meteo uragano su Great Swan dal 1938 in poi, ma il personale solo durante le stagioni degli uragani.

Durante la seconda guerra mondiale, sia la Marina degli Stati Uniti che l’Ufficio meteorologico degli Stati Uniti stazionarono personale sull’isola. Alla fine del 1940 fino al 1949, Swan Island divenne una stazione di quarantena per animali del Dipartimento dell’Agricoltura degli Stati Uniti per l’importazione di carne bovina. Nel 1914, quello che oggi è il National Weather Service (NWS) e, più tardi, la Federal Aviation Agency (FAA) istituito risorse meteorologiche e di comunicazione su Swan per sostenere i servizi aeronautici e le attività di previsione degli uragani. La FAA partì Swan Island nel 1960, lasciando il NWS tutte le attività e le responsabilità.

L’Honduras rivendicò queste isole dal 1923, affermando che, poiché Colombo aveva scoperto le isole mentre navigava per la Spagna, dovevano essere di proprietà del paese di lingua spagnola più vicino. Sia gli Stati Uniti che l’Honduras rivendicarono le Isole Swan fino a quando gli Stati Uniti non abbandonarono la loro rivendicazione ai sensi del Guano Islands Act. Un trattato fu firmato il 22 novembre 1971 e il titolo chiaro dell’Honduras divenne effettivo il 1º settembre 1972. La proprietà dell’isola era stata a lungo in discussione. La famiglia Sumner Smith ha sempre mantenuto la loro proprietà e, apparentemente, ha avuto un po ” in piedi nella U.S. corti. Tuttavia, il governo americano ha scelto di abbandonare la sua affermazione nonostante questa posizione (ref. D S Platt, et al., NOAA-NWS). Le isole hanno guadagnato notorietà nei primi anni 1960 dalle attività di Radio Swan, che ha iniziato a trasmettere nel maggio 1960 durante la preparazione e, più tardi, lo svolgimento della Baia dei Porci Invasione di Cuba. La stazione è stata rimossa dalle isole alla fine del 1960, il suo trasmettitore principale poi trasferito per l’uso nella guerra del Vietnam.

Nel 1965, a Bellaire, in Texas, la polizia interrogò un ex studente della Bellaire High School sul suo ruolo in un “esercito” adolescente dedicato alla liberazione di “paesi oppressi”, riportava lo Houston Chronicle. Il gruppo, chiamato Kononiers, esisteva da circa cinque anni, ha detto lo studente al giornale, ed era armato attraverso una serie di furti nel negozio di armi Deep River. Le armi sono state portate nell’area del bacino idrico di Addicks, dove si sono allenate per il combattimento. I giovani si stavano allenando per” Operazione Liberazione Isola dei cigni ” al largo dell’Honduras.

Nel 1987, il Los Angeles Times riportò che la CIA e altre agenzie governative americane avevano una struttura di addestramento segreta a Swan Island per i Contras nicaraguensi. Nel 1989, il presidente dell’Honduras, Rafael Leonardo Callejas, ha dichiarato l’isola un rifugio protetto della fauna selvatica.

Nell’ottobre 1998, l’uragano Mitch si spostò attraverso l’area con venti di 290 km/h (180 mph).

Nel 2001, Swan Island Development, LLC, di Brooksville, Florida, ha annunciato piani per sviluppare le Isole Swan entro il 2010, in collaborazione con il governo dell’Honduras. Sono stati immaginati immobili di lusso e hotel, del valore di cinque miliardi di dollari, con una città principale chiamata Cygnet. Nel 2004, Swan Island Development ha anche annunciato l’intenzione di istituire un centro di ricerca sulle cellule staminali umane. A partire dal 2021, nessuno dei quali si è verificato.