L’area era originariamente abitata da indiani Tlingit. Fu esplorato da una spedizione russa nel 1741, e Old Sitka, o Fort St. Michael, fu fondata nel luglio 1799 da Aleksandr Baranov (Baranof), il primo governatore russo dell’Alaska. Il forte fu distrutto dai Tlingit nel 1802. L’attuale città fu fondata come Novo Arkhangelsk (“Nuovo Arcangelo”) nel 1804, quando Baranov trasferì la sede della Società russo-americana (una società commerciale russa) lì da Kodiak. Dopo il 1867 l’insediamento era comunemente noto come Sitka (derivato da una frase Tlingit che significa “all’esterno di Shee “). Il trasferimento formale dell’Alaska dalla Russia agli Stati Uniti ebbe luogo lì il 18 ottobre 1867, e Sitka servì come capitale territoriale fino al 1906, quando la sede del governo fu spostata a Juneau. Il governo degli Stati Uniti vi costruì una base aerea navale durante la seconda guerra mondiale, che fece salire la popolazione a quasi 40.000 abitanti. La base è ora gestita dalla Guardia Costiera degli Stati Uniti.

Le principali attività economiche di Sitka sono la pesca, l’inscatolamento, il legname e il turismo. La città è anche un centro sanitario regionale. St. La Cattedrale di Michele (ortodossa russa, 1848) fu la prima chiesa russa costruita in Nord America; fu ricostruita dopo che un incendio la distrusse nel 1966. Sheldon Jackson College (1878) ha un museo che ospita più antica dello stato e una delle migliori collezioni di manufatti nativi e ricordi russi. Sitka è anche il sito di un campus della University of Alaska Sud-est. WhaleFest (fondata nel 1995), che si tiene ogni anno nel mese di novembre, celebra la migrazione delle megattere attraverso Sitka Sound. Una destinazione turistica popolare è il centro di riabilitazione raptor della città. Sitka si trova nella foresta Nazionale di Tongass. Nelle vicinanze si trova Sitka National Historical Park, il sito di una battaglia cruciale tra russi e indiani Tlingit nel 1804; contiene anche la Casa del vescovo russo, sentieri e totem. Il monte Edgecumbe (3.201 piedi ), un vulcano dormiente sull’isola di Kruzof, è un punto di riferimento cospicuo nel porto costellato di isole e montagne di Sitka. Inc. 1913. Pop. (2000) 8,835; (2010) 8,881.