La maggior parte dei ceppi sono altamente adattati ad un ciclo di vita asessuata. In assenza di meiosi, la plasticità cromosomica è la norma e diversi ceppi hanno diversi numeri e dimensioni di cromosomi. La maggior parte delle cellule ha numerosi nuclei, con alcune cellule vegetative che ne possiedono più di 100. Vari fattori genetici asessuati, come la ricombinazione parasessuale, la mutazione e altri processi contribuiscono alla variazione tra i nuclei in un singolo organismo (tallo). Pertanto, i funghi sono altamente adattabili e si evolvono rapidamente. C’è una grande diversità nel genotipo e nel fenotipo dei ceppi selvatici.

Mentre i ceppi selvatici sono altamente adattabili e possono essere eterocariotici (contengono nuclei di genotipo dissimile all’interno di un singolo organismo, e quindi altamente variabili), i ceppi utilizzati per il biocontrollo nell’agricoltura commerciale sono, o dovrebbero essere, omocariotici (i nuclei sono tutti geneticamente simili o identici). Questo, insieme a uno stretto controllo della variazione attraverso la deriva genetica, consente a questi ceppi commerciali di essere geneticamente distinti e non variabili. Questo è un elemento di controllo di qualità estremamente importante per qualsiasi azienda che desidera commercializzare questi organismi.