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Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping

Abstract

Una vasta collezione di buoni marcatori genetici è necessaria per mappare i geni che causano malattie genetiche umane. Sebbene siano stati descritti quasi 400 marcatori polimorfici del DNA per i cromosomi umani, la maggior parte ha solo due alleli e sono quindi non informativi per l’analisi del legame genetico in molte famiglie. Alcuni sistemi di marcatori noti, tuttavia, rilevano loci che rispondono alla scissione degli enzimi di restrizione producendo un frammento che può avere molte lunghezze diverse. Questo polimorfismo è dovuto alla variazione del numero di ripetizioni tandem di una breve sequenza di DNA. Poiché la maggior parte degli individui sarà eterozigote in tali loci, questi marcatori forniranno informazioni di collegamento in quasi tutte le famiglie. Dieci sequenze oligomeriche derivate dalle regioni di ripetizione tandem del gene della mioglobina, lo pseudogene zeta-globina, il gene dell’insulina e la regione del gene X del virus dell’epatite B, sono state utilizzate per sviluppare una serie di sonde a copia singola. Queste sonde hanno rivelato nuovi loci genetici altamente polimorfici le cui dimensioni dell’allele riflettevano la variazione del numero di ripetizioni tandem.