Ha fondato nel 1984 il Bay Area Laboratory Co-operative (BALCO), un centro di nutrizione sportiva prima situato a Millbrae, in California e successivamente trasferito a Burlingame, in California. L’agenzia antidoping degli Stati Uniti (USADA) dice che ha sviluppato il tetraidrogestrinone steroide vietato (THG) con l’aiuto del chimico di culturismo Patrick Arnold. Ai sensi di un patteggiamento ha colpito con i pubblici ministeri, è entrato motivi di colpevolezza nel luglio 2005 per un conteggio di cospirazione per distribuire steroidi e un secondo conteggio di riciclaggio di una parte di un assegno. E ” stato condannato nel mese di ottobre a trascorrere quattro mesi nel federal Taft Correctional Institution a Taft, California, e altri quattro agli arresti domiciliari.

Nel dicembre 2004, ha partecipato a un’intervista con Martin Bashir sul programma ABC 20/20, dove ha ammesso di aver eseguito programmi di doping, che hanno battuto i record olimpici, oltre a rivelare che: “L’intera storia dei giochi è piena di corruzione, insabbiamento, uso di droghe che migliorano le prestazioni.”

Nell’intervista ha implicato, tra gli altri, la cinque volte medaglia d’oro olimpica Marion Jones e il suo partner Tim Montgomery, Kelli White (che in seguito ha ammesso di aver usato droghe per migliorare le prestazioni), l’atleta britannico Dwain Chambers e il giocatore NFL Bill Romanowski.

Il 21 dicembre 2006, Yahoo Sports ha riferito che uno degli avvocati difensori iniziali di Conte, Troy Ellerman, era stato preso di mira dall’FBI come possibile fonte di perdite ai media durante la sonda Barry Bonds. Il 14 febbraio 2007, Ellerman si è dichiarato colpevole di aver perso la testimonianza del grand jury. È stato anche riferito che gli agenti dell’FBI erano un’ulteriore fonte di perdite.

Nel maggio 2007, Conte ha affermato di fornire nuovamente supplementi per Dwayne Chambers, che ha lasciato gli athletics per giocare nella NFL Europa league per gli Hamburg Sea Devils prima di tornare agli athletics nel 2008. Secondo Conte, questi integratori alimentari, forniti tramite la sua azienda Scientific Nutrition per il condizionamento avanzato, sono perfettamente legali.

Il 13 dicembre 2007 Conte è apparso sulla CNN prima che il rapporto Mitchell fosse ufficialmente rilasciato.