最初の理解の系統発生の記事では、キャンディバーの系統発生を使用していくつかの基本的な系統発生 主なポイントは、枝とノードのレイアウト（別名トポロジー）は、キャンディバー（別名分類群）がそれらの特性（この場合はキャンディの形や味）に基づいて互いに しかし、あなたは偽の関係の数に気づいている可能性があります。

例えば（図3A）：
•ヨークペパーミントパティとチェリーマッシュは本当に姉妹分類群であるという理由だけで、彼らは丸いですか？
•ピーナッツとココナッツクレードを姉妹分類群として結びつけるものは何ですか？
*ピーナッツクレードでは、ピーナッツバター（リースのピーナッツバターカップ）はピーナッツ（給料日）または”ピーナッツバター-y”充填（バターフィンガー）に姉妹ですか？
•”ドロップ”と”フラットバー”キャンディーの共通の祖先は何ですか？答えは、元のツリー内の関係のいくつかは意味をなさないということです。

答えは、元のツリーの関係のいくつかは意味をなさないということです。 私は分類群を完全に分岐する木に強制しました（図3A）。 しかし、ツリーを強制的に分岐させず、ツリー上のポリトミーを許可することによって、あいまいさを表示することができます（図3B）。 ポリトミーは、データの不確実性または情報の欠如のいずれかを表すことができます。 ポリトミーが不確実性や情報の欠如を表すかどうかを見分けることは、研究者とシステムとデータの知識次第です。 彼らは、ツリーを解決するために、より多くのデータ（ex-extra taxaまたはより多くの文字特性）を収集することができるかもしれません。 しかし、いくつかのポリトミーは解決することができず、単に研究者が分析を進める際に考慮しなければならない不確実性を反映しています。

形質に与えられた重みは、分岐（図3A）とポリトミー（図3B）の木の違いに貢献しています。 キャンディ形状を考慮した場合（図3A）、フレーバーは先端の近くに分類群をグループ化し、形状は根に近いクレード群をグループ化する。 しかし、形状を考慮しなかった場合、グループ化は風味によってのみ行われ、いくつかのクレードが複数の風味プロファイルを共有しなかったため、根の近く分類群間のすべての関係が記述されていないため、ポリトミーはイライラするかもしれませんが、系統発生の構築と解釈の非常に現実的な部分です。

したがって、ポリトミーは進化パターンの解釈の実際の部分でもあります。 （あなたはこのインタラクティブなウェブサイト上の生命の木全体で多くのpolytomiesを見ることができます。