ABSTRAKT

det ribosomale peptidyltransferasesenteret (PTC) ligger I den store ribosomale underenheten og katalyserer de to viktigste kjemiske reaksjonene av proteinsyntese: peptidbindingsdannelse og peptidfrigivelse. De katalytiske mekanismene som brukes og deres inhibering av antibiotika har vært i fokus for molekylære og strukturelle biologer i flere tiår. Med avklaring av atomstrukturer av den store ribosomale underenheten ved begynnelsen av det nye årtusenet, fikk disse spørsmålene et nytt nivå av molekylær betydning. De krystallografiske strukturer bekreftet overbevisende at peptidyltransferase er ET RNA-enzym. Dette plasserer ribosomet på listen over naturlig forekommende riboyzmes som overlevde overgangen fra den pre-biotiske RNA-Verdenen til moderne biologi. Biokjemiske, genetiske og strukturelle bevis markere rollen av ribosomet som en entropisk katalysator som akselererer peptidbinding dannelse primært ved substratposisjonering. Samtidig bør peptidfrigjøring i større grad avhenge av kjemisk katalyse som sannsynligvis involverer en rrna-gruppe AV PTC. PTC er preget av den mest utprøvde akkumuleringen av universelt konserverte rrna-nukleotider i hele ribosomet. Dermed kom det som en overraskelse at nyere funn viste et uventet høyt nivå av variasjon i modusen for antibiotikabinding TIL ptc av ribosomer fra forskjellige organismer.