i Den første Forståelse Phylogenies post, jeg skissert noen grunnleggende phylogenetic terminologi ved hjelp av en candy bar fylogeni. Hovedpoenget er at oppsettet (aka-topologi) av grener og noder illustrert hvordan candy barer (aka-taxa) var relatert til hverandre basert på deres egenskaper (i dette tilfellet candy form eller smak). Derimot, du har kanskje lagt merke til en rekke falske relasjoner.

For Eksempel (Figur 3A):
• Er York Peppermynte Karbonader og Kirsebær Mos virkelig søster taxa bare fordi de er runde?
• hva forener peanøtter og kokos clades som søster taxa?* i peanut clade, er peanøttsmør (Reece ‘S Peanut Butter Cups) søster til peanøtter (Lønning) eller til» peanut butter-y » fylling (Butterfinger)?r• * hva er felles stamfar mellom» Drops «og» Flat Bar » godteri?

svaret er at noen av relasjonene i det opprinnelige treet ikke gir mening. Jeg tvang taxa inn i et fullt bifurcating tre (Figur 3A). Vi kan imidlertid vise tvetydighet ved ikke å tvinge treet til å bifurcate og tillate polytomier på treet (Figur 3B). Polytomier kan enten representere usikkerhet i dataene eller mangel på informasjon. Å vite om en polytomi representerer usikkerhet eller mangel på informasjon, er opp til forskeren og deres kunnskap om systemet og dataene. De kan være i stand til å samle inn flere data (ex – ekstra taxa eller flere karaktertrekk ) for å løse treet. Men noen polytomier kan ikke løses og bare reflektere usikkerhet som forskere må redegjøre for når de går videre med sine analyser.

vekten gitt til egenskapene bidrar til forskjellen mellom bifurcating (Figur 3a) og polytomy (Figur 3B) trær. Når candy form ble vurdert (Figur 3A), smaken grupper taxa nær tips, men form grupper clades nærmere roten. Men når form ikke ble vurdert, ble grupperinger bare gjort av smak og det var utilstrekkelige data for å fullstendig bifurcate treet nær roten, da noen klader ikke delte flere smakprofiler.mens polytomier kan være frustrerende fordi alle forholdene mellom taxa ikke er beskrevet, er de en veldig reell del av å bygge og tolke fylogenier. Derfor er polytomier også en reell del av tolkningen av evolusjonære mønstre. (Du kan se mange polytomier over Livets Tre på denne interaktive nettsiden.)