TEKST

Nedre luftveisinfeksjoner er den ledende årsaken til infeksjonsrelatert sykehusinnleggelse i Usa (13). Vi har tidligere bestemt hyppigheten av spesifikke virusinfeksjoner forbundet med akutte luftveissykdommer som fører til sykehusinnleggelser (5). Pasienter som deltok i studien ble innlagt på et offentlig eller privat sykehus, og respiratoriske virusinfeksjoner ble identifisert ved cellekultur og serologiske studier. Fordi antall luftveisvirusinfeksjoner assosiert med luftveissykdommer kan økes ved bruk av revers transkripsjon-PCR (RT-PCR) – analyser (3, 6), brukte vi disse analysene på prøver som ble samlet inn og satt til side for dette formålet over en 2-års periode for å avgjøre om ytterligere luftveisvirusinfeksjoner kunne identifiseres i denne kohorten.

detaljene i den kliniske studien er beskrevet tidligere (5). Kort sagt var studiedeltakere personer i alle aldre som ble innlagt på Ben Taub General Hospital eller St. Luke ‘ S Episcopal Hospital I Houston, TX, med akutt respiratorisk tilstand (lungebetennelse, tracheobronitt, bronkiolit, croup, forverring av astma eller kronisk obstruktiv lungesykdom eller kongestiv hjertesvikt). Åndedrettsprøver (nasal vask eller halsprøve) og serumprøver ble samlet inn innen en median på 1 dag etter sykehusinnleggelse. Denne substudien ble utført på deltakere som ble registrert fra 1. September 1993 til slutten Av studien I Mai 1995. Åndedrettsprøven ble blandet med kalvekjøttinfusjonsbuljong som stabilisator på innsamlingstidspunktet, transportert til laboratoriet på våt is og inokulert på cellekultur. Den gjenværende prøven ble aliquotert og frosset ved < -70°C til testet ved bruk av molekylære analyser(beskrevet nedenfor). Generelt gjennomgikk prøver en eller to frysetiner for å generere cDNA for første testing. En rekonvalesentfaset serumprøve ble oppnådd 14 til 42 dager senere. Alle fag gitt informert samtykke under en protokoll godkjent Av Baylor College Of Medicine Institutional Review Board.

metodene som brukes for cellekultur og serologi ble beskrevet tidligere (5). Cellekulturanalysene ble testet for type a og b influensavirus, parainfluensavirus (PIV) type 1 til 3, respiratorisk syncytialt virus (RSV), rhinovirus, enterovirus, herpesvirus og adenovirus. Serologiske analyser ble utført som tidligere beskrevet (5) på parede serumprøver for influensa a-og b-virus, PIV type 1 til 3, RSV OG koronavirus 229E OG OC43.RT-PCR-analyser ble utført ved bruk av tidligere beskrevne RT-PCR-analyser i sanntid for influensa a-og b-virus OG koronavirus OC43 OG 229E (3). PIV – typer 1 til 3 (HENHOLDSVIS PIV1, PIV2 og PIV3), RSV, humant metapneumovirus (HMPV) og pikornavirusinfeksjoner ble identifisert ved bruk av TIDLIGERE beskrevne RT-PCR-analyser etterfulgt Av Southern blot hybridisering (3). Pikornaviruspositive prøver ble videre klassifisert ved hjelp av rhinovirus-og enterovirus-spesifikke RT-PCR-analyser i sanntid når det var tilstrekkelig prøve igjen for disse analysene (8, 11).

i alt 403 separate sykdommer forekom i løpet av den 2-årige studieperioden hos 364 personer. Syttiseks respiratoriske virus (unntatt herpes simplex virus og cytomegalovirus ) ble isolert fra 75 sykdomsprøver samlet i studieperioden. Disse inkluderte 26 pikornavirus, 21 RSV, 19 influensavirus, 4 adenovirus og 2 HVER AV PIV1, PIV2 og PIV3 (Tabell 1). Tretti sykdommer (av 136 parede sera testet) hadde også 33 infeksjoner identifisert ved serologi, hvorav 11 ble identifisert ved kultur(6 influensa a subtype H3N2, 4 RSV og 1 influensa B). Ytterligere infeksjoner identifisert ved serologi, men ikke ved kultur, inkluderte syv A/H3N2, tre HVER AV RSV, PIV2, PIV3 og OC43, og en hver AV A/H1N1, PIV1 og 229E.

Pusteprøver fra 386 sykdommer (95 .8%) var tilgjengelig for molekylær testing. Ett hundre syttito (44,6%) prøver var positive for minst ett av virusene som ble analysert (Tabell 1), med et pikornavirus (n = 99) som den vanligste infeksjonen identifisert. Alle virus HVOR RT-PCR-analyser ble utført ble påvist unntatt PIV2; INGEN piv2-infeksjoner ble identifisert AV RT-PCR, mens to infeksjoner ble funnet ved bruk av cellekultur. Totalt var 200 (49,6%) av de 403 sykdommene forbundet med minst en virusinfeksjon. Mer enn en virusinfeksjon ble identifisert i 33 sykdommer (31 med to infeksjoner og 2 med tre infeksjoner). Tjuefire av de flere infeksjonene inkluderte et pikornavirus, med et pikornavirus og RSV som den vanligste kombinasjonen (n = 10); dobbel infeksjon MED RSV og influensa a-virus ble påvist i 3 sykdommer. Et annet respiratorisk virus ble identifisert i alle tre sykdommene HVORFRA CMV ble isolert og i 6 av de 11 sykdommene HVORFRA HSV ble isolert.

en virusinfeksjon ble identifisert hos 77,6% av barna under 5 år (Tabell 2). Eldre barn hadde en infeksjon identifisert i mer enn 50% av deres sykdommer, og voksne hadde en infeksjon identifisert i omtrent en tredjedel av deres sykdommer. Flere infeksjoner ble identifisert hyppigst hos barn under 1 år.

anvendelsen av molekylære metoder for diagnostisering av respiratoriske virusinfeksjoner har økt hyppigheten av påvisning av respiratoriske virusinfeksjoner hos pasienter med eksaserbasjoner av astma (1, 6), kronisk obstruktiv lungesykdom (3, 12) og bronkiolitt (4, 10) og i prøver som er sendt inn for generelle respiratoriske virusdiagnostiske studier (2, 9). Vi har tidligere utført en epidemiologisk studie som undersøkte virkningen av luftveisinfeksjon på en samfunnskohort ved hjelp av tradisjonelle (kultur og serologi) virale diagnostiske metoder. BRUK AV RT-PCR-analyser på prøver samlet i denne studien økte antallet virusinfeksjoner identifisert med ca. 2 ganger på grunn av økt sensitivitet av analysen for noen virus (f.eks. pikornavirus) sammenlignet med cellekultur og på grunn av evnen til å identifisere andre virus som er dårlig eller ikke dyrkbare (F. eks. HMPV og koronavirus).

familien av virus med størst frekvens av deteksjon var picornavirus (enterovirus og rhinovirus arter), som ble identifisert i ca 25% av sykdomsepisoder. Fordi rhinovirus-og enterovirus-spesifikke primere som ble brukt ikke ble validert mot alle arter av rhinovirus og enterovirus, er det mulig at ytterligere uoppdagede pikornavirusinfeksjoner kan ha blitt savnet. Den økte identifikasjonen av pikornavirusinfeksjoner ved bruk av molekylære analyser er i tråd med funn i andre studier av barn under 5 år og pasienter med astma, KOLS og bronkiolitt (1, 6, 7, 10, 12).

i sammendraget økte bruken av molekylære diagnostiske analyser hyppigheten av identifisering av en respiratorisk virusinfeksjon hos personer innlagt på akuttsykehus med akutt respiratorisk tilstand. I denne kohorten var mer enn 75% av respiratoriske sykdommer hos barn under 5 år forbundet med påvisning av et respiratorisk virus, sammenlignet med 25 til 37% av sykdommene hos voksne. Forekomsten av respiratoriske virusinfeksjoner kan ha vært enda høyere siden vi ikke analyserte FOR NL63 eller hku1 koronavirus eller PIV type 4. Picornavirus (hovedsakelig rhinovirus) infeksjoner var de vanligste infeksjonene identifisert hos pasienter i alle aldre, etterfulgt av DE forårsaket AV RSV og influensavirus. Bruken av molekylære analyser øker hyppigheten av å identifisere en respiratorisk virusinfeksjon sammenlignet med de klassiske virale diagnostiske metodene for cellekultur og serologi.