i 1868, middelalderbyen Edo, sete For Tokugawa regjeringen, ble omdøpt Tokyo, og kontorene Til Tokyo Prefecture (- fu) ble åpnet. Omfanget Av Tokyo Prefektur var opprinnelig begrenset til Den tidligere Edo city, men raskt utvidet til å være sammenlignbar Med dagens Tokyo Metropolis. I 1878 delte Meiji-regjeringens reorganisering av lokale myndigheter prefekturer i fylker eller distrikter (gun, videre delt inn i byer og landsbyer, senere omorganisert som Prøyssiske distrikter) og distrikter eller avdelinger (ku) som var i vanlige prefekturbyer som helhet, for eksempel Dagens Hiroshima City (- shi) var Da Hiroshima-ku; De tre store byene Tokyo, Osaka og Kyoto ble hver delt inn i flere slike avdelinger. I Tokyo Prefektur skapte dette 15 avdelinger (oppført nedenfor) og seks fylker / distrikter.i 1888 opprettet den sentrale regjeringen det juridiske rammeverket for dagens system av byer (shi) som ga noen grunnleggende lokale autonomirettigheter-med noen likheter Med Preussens system for lokalt selvstyre Som Meiji-regjeringens rådgiver Albert Mosse påvirket tungt organiseringen av lokale myndigheter. Men Under en spesiell keiserlig regulering opprettholdt Tokyo city, Som Kyoto City og Osaka City, i utgangspunktet ikke en egen borgmester; i stedet tjente den (utnevnte) guvernøren I Tokyo Prefektur som borgmester I Tokyo City. Tokyo bystyre /forsamling (Tōyō-shikai) ble først valgt I Mai 1889. Hver menighet beholdt også sin egen forsamling. By-og prefekturregjeringen ble separert i 1898., og regjeringen begynte å utnevne en egen ordfører I Tokyo i 1898, men beholdt menighetslovgivning, som fortsetter til denne dagen i det spesielle menighetssystemet. Fra 1926 ble ordføreren valgt av det valgte bystyret / forsamlingen fra sine egne ranger. Rådhuset I Tokyo lå I Distriktet Y ③rakuchō, på et område som nå er okkupert Av Tokyo International Forum.Tokyo ble den nest største byen i verden (befolkning 4,9 millioner) ved å absorbere flere avsidesliggende distrikter i juli 1932, noe som gir byen totalt 35 avdelinger.i 1943 ble Byen avskaffet og slått sammen Med Tokyo Prefektur for å danne Tokyo Metropolitan Government, som funksjonelt var en del Av Den sentrale regjeringen I Japan: guvernøren I Tokyo ble En Statsråd som rapporterte direkte til Statsministeren. Dette systemet forble på plass til 1947 da Den nåværende strukturen I Tokyo Metropolitan Government ble dannet.