Aspergillus en Candida spp zijn de meest voorkomende geïsoleerde schimmels bij patiënten met otomycose. De diagnose van otitis externa berust op de geschiedenis van de patiënt, otoscopisch onderzoek onder microscopische controle, en beeldvormingsstudies. Directe bereiding van de monsters, met name met optische witmakers, mycologische cultuur en histologisch onderzoek, is zeer belangrijk en sterk aanbevolen voor de juiste diagnose. Patiënten met niet-invasieve schimmelinfecties otitis externa moeten worden behandeld met intense débridement en reiniging, en topische antischimmelmiddelen. Actuele schimmeldodende middelen, zoals clotrimazol, miconazol, bifonazol, ciclopiroxolamine, en tolnaftate, zijn potentieel veilige keuzen voor de behandeling van otomycose, vooral in patiënten met een geperforeerd trommelvlies. De mondelinge triazole drugs, Itraconazole, voriconazol, en posaconazole zijn efficiënt tegen Candida en Aspergillus, met goede penetratie van Been en het centrale zenuwstelsel. Deze geneesmiddelen zijn essentieel bij de behandeling van patiënten met kwaadaardige schimmelontsteking otitis externa gecompliceerd door mastoïditis en meningitis.