streszczenie

centrum rybosomalnej peptydy transferazy (PTC) znajduje się w dużej podjednostce rybosomalnej i katalizuje dwie główne reakcje chemiczne syntezy białek: tworzenie wiązania peptydowego i uwalnianie peptydów. Zastosowane mechanizmy katalityczne i ich hamowanie przez antybiotyki są od dziesięcioleci przedmiotem zainteresowania biologów molekularnych i strukturalnych. Wraz z wyjaśnieniem struktur atomowych Wielkiej podjednostki rybosomalnej u zarania nowego tysiąclecia, pytania te zyskały nowy poziom znaczenia molekularnego. Struktury krystalograficzne potwierdziły, że transferaza peptydylowa jest enzymem RNA. Umieszcza to rybosom na liście naturalnie występujących rybozymów, które przetrwały przejście ze świata pre-biotycznego RNA do współczesnej biologii. Biochemiczne, genetyczne i strukturalne dowody podkreślają rolę rybosomu jako entropowego katalizatora, który przyspiesza tworzenie wiązania peptydowego głównie przez pozycjonowanie substratu. Jednocześnie uwalnianie peptydów powinno silniej zależeć od katalizy chemicznej, prawdopodobnie obejmującej grupę rRNA PTC. PTC charakteryzuje się najbardziej wyraźnym nagromadzeniem powszechnie zachowanych nukleotydów rRNA w całym rybosomie. Tak więc, było zaskoczeniem, że ostatnie odkrycia ujawniły nieoczekiwany wysoki poziom zmienności w sposobie wiązania antybiotyków z PTC rybosomów z różnych organizmów.