Taksonomia to nauka, która bada, opisuje, nazywa i klasyfikuje wszystkie organizmy. W tym rozdziale wprowadzającym podkreślamy główne historyczne kroki w opracowaniu tej nauki, która dostarcza danych podstawowych dla wszystkich dziedzin biologii i odgrywa istotną rolę dla społeczeństwa, ale jest również niezależną, złożoną i solidną dyscypliną naukową opartą na hipotezach.W pierwszej części podkreślamy, że Taksonomia roślin jest jedną z najwcześniejszych dyscyplin naukowych, które pojawiły się tysiące lat temu, nawet przed ważnym wkładem Greków i Rzymian (np. Teofrastus, Pliniusz Starszy i Dioscorides). W XV-XVI wieku Taksonomia roślin skorzystała na wielkich nawigacjach, wynalezieniu prasy drukarskiej, utworzeniu ogrodów botanicznych i zastosowaniu techniki suszenia do konserwacji okazów roślin. Równolegle z rosnącym zbiorem danych morfo-anatomicznych, kolejne główne etapy w historii taksonomii roślin obejmują pojawienie się koncepcji klasyfikacji naturalnej, przyjęcie dwumianowego systemu nazewnictwa (z główną rolą Linneusza) i innych uniwersalnych zasad nazewnictwa roślin, sformułowanie Zasady podporządkowania postaci i pojawienie się myśli ewolucyjnej. Niedawno teoria kladystyczna (zainicjowana przez Henniga) i szybki postęp w technologiach DNA pozwoliły wnioskować filogenezy i proponować prawdziwe naturalne, oparte na genealogii classifications.In w drugiej części kładziemy nacisk na wyzwania, przed którymi stoi obecnie Taksonomia roślin. Wciąż bardzo niepełna wiedza taksonomiczna o florze światowej (tzw. utrudnienie taksonomiczne) poważnie utrudnia wysiłki na rzecz ochrony, które są szczególnie istotne, ponieważ bioróżnorodność wchodzi w szósty kryzys wymierania. Wydaje się, że wynika to głównie z niewystarczającego finansowania, braku wiedzy taksonomicznej oraz braku komunikacji i koordynacji. Następnie dokonujemy przeglądu ostatnich inicjatyw mających na celu przezwyciężenie tych ograniczeń i przewidywanie, w jaki sposób Taksonomia powinna i mogłaby ewoluować. W szczególności wykorzystanie danych molekularnych zostało podzielone na epoki dla taksonomii i może pozwolić na przyspieszone tempo odkrywania gatunków. Badamy zarówno mocne, jak i ograniczenia takich technik w porównaniu do badań opartych na morfologii, przedstawiamy szerokie zalecenia dotyczące wykorzystania narzędzi molekularnych do taksonomii roślin oraz podkreślamy potrzebę integracyjnej taksonomii opartej na dowodach z wielu źródeł.