no primeiro entendimento de filogenias post, eu delineei alguma terminologia filogenética básica usando uma filogenia de chocolate. O ponto principal é que o layout (aka – topologia) de ramos e nós ilustrou como barras de chocolate (aka – taxa) estavam relacionados uns com os outros com base em suas características (neste caso, a forma de doces ou sabor). No entanto, você pode ter notado uma série de relações espúrias.

Por exemplo (figura 3A):
• are York Peppermint Patties and Cherry Mash really sister taxa just because they are round?* What units the peanut and coconut clades as sister taxa?* In The peanut clade, is peanut butter (Reece’s Peanut Butter Cups) sister to peanuts (PayDay) or to “peanut butter-y” filling (Butterfinger)?
• Qual é o ancestral comum entre” Drops “e” Flat Bar ” doces?

a resposta é que algumas das relações na árvore original não fazem sentido. Forcei os taxa a uma árvore totalmente bifurcante (figura 3A). No entanto, podemos mostrar ambiguidade ao não forçar a árvore a bifurcar e permitir politomias na árvore (figura 3B). As politomias podem representar incerteza nos dados ou falta de informação. Discernir se uma politomia representa incerteza ou falta de informação depende do investigador e do seu conhecimento do sistema e dos dados. Eles podem ser capazes de coletar mais dados (ex – taxa extra ou mais características de caráter ) para resolver a árvore. No entanto, algumas politomias não podem ser resolvidas e reflectem simplesmente a incerteza que os investigadores devem ter em conta à medida que avançam com as suas análises.

o peso dado aos traços contribui para a diferença entre as árvores de bifurcação (figura 3A) e de politomia (figura 3B). Quando a forma dos doces foi considerada( figura 3A), os grupos de sabor agrupam os taxa perto das pontas, mas os grupos de forma agrupam-se mais perto da raiz. No entanto, quando a forma não foi considerada, os agrupamentos foram feitos apenas por sabor e não havia dados suficientes para bifurcar completamente a árvore perto da raiz, como alguns clados não compartilham múltiplos Perfis de sabor.

embora as politomias possam ser frustrantes porque todas as relações entre taxa não são descritas, elas são uma parte muito real da construção e interpretação de filogenias. Portanto, as politomias também são uma parte real da interpretação de padrões evolutivos. (Você pode ver muitas politomias através da árvore da vida neste site interativo.)