Acest capitol discută pe scurt Originea speciilor lui Darwin și volumul său însoțitor variația animalelor și plantelor sub domesticire. În cea de-a doua mare carte, Darwin a făcut un studiu amplu al întregii game de variații și ereditate și și-a dezvoltat Pangeneza, o teorie celulară extinsă și o teorie genetică unificată care să-i întărească teoria evoluției și să explice numeroasele fenomene ale vieții. Ipoteza esențială a Pangenezei este existența particulelor sau moleculelor moștenite numite gemmule și producerea lor de către celule în fiecare etapă de dezvoltare. El a presupus că, pe lângă diviziunea celulară obișnuită, celulele ar putea, de asemenea, „arunca” numeroase și minuscule gemmule, care erau capabile de auto-replicare și repaus, difuzie de la celulă la celulă sau circulație prin corp, modificare prin efectele utilizării și neutilizării sau schimbărilor de mediu, unirea cu celulele născute, agregarea în muguri și celule germinale și transmiterea de la părinte la urmași. Prin Pangeneza sa, Darwin nu numai că a explicat fenomenele generale legate de moștenire, variație, dezvoltare și reproducere, ci și moștenirea personajelor dobândite, prepotența, hibridizarea grefei, reversia, regenerarea, xenia, Telegonia, transpunerea, moștenirea legată de sex, moștenirea și non-moștenirea mutilării și multe alte fapte. Darwin l-a numit pe Pangenesis „copilul său iubit” și a crezut cu tărie că „se va dovedi adevărat într-o zi!”