Centrul peptidil transferazei ribozomale: structură, funcție, evoluție, inhibiție
rezumat
Centrul peptidil transferazei ribozomale (PTC) se află în subunitatea ribozomală mare și catalizează cele două reacții chimice principale ale sintezei proteinelor: formarea legăturii peptidice și eliberarea peptidelor. Mecanismele catalitice utilizate și inhibarea lor de către antibiotice au fost în centrul atenției biologilor moleculari și structurali de zeci de ani. Odată cu elucidarea structurilor atomice ale subunității ribozomale mari la începutul noului mileniu, aceste întrebări au câștigat un nou nivel de semnificație moleculară. Structurile cristalografice au confirmat în mod convingător că peptidil transferaza este o enzimă ARN. Acest lucru plasează ribozomul pe lista riboyzme-urilor care apar în mod natural, care au supraviețuit tranziției de la lumea ARN pre-biotică la biologia contemporană. Dovezile biochimice, genetice și structurale evidențiază rolul ribozomului ca un catalizator entropic care accelerează formarea legăturii peptidice în primul rând prin poziționarea substratului. În același timp, eliberarea peptidelor ar trebui să depindă mai puternic de cataliza chimică care implică probabil un grup ARNr al PTC. PTC se caracterizează prin cea mai pronunțată acumulare de nucleotide ARNr conservate universal în întregul ribozom. Astfel, a fost o surpriză faptul că descoperirile recente au relevat un nivel ridicat neașteptat de variație în modul de legare a antibioticelor la PTC a ribozomilor din diferite organisme.