Nașterea tragediei a fost criticată furios de mulți cercetători profesioniști respectați ai literaturii grecești. Deosebit de vehement a fost filologul Ulrich von Wilamowitz-Moellendorff, care a denunțat opera lui Nietzsche ca fiind înșelătoare și înșelătoare. Îndemnat de Nietzsche, Erwin Rohde—un prieten care scrisese o recenzie favorabilă care a declanșat prima dezbatere disprețuitoare asupra cărții-a răspuns expunând citările inexacte ale lui Wilamowitz-Moellendorf despre opera lui Nietzsche. Richard Wagner a emis, de asemenea, un răspuns la critica lui Wilamowitz-Moellendorf, dar acțiunea sa a servit doar pentru a-l caracteriza pe Nietzsche drept lacheul compozitorului.

în denunțarea nașterii tragediei, Wilamowitz spune:

Herr N. … este, de asemenea, profesor de filologie clasică; tratează o serie de întrebări foarte importante ale istoriei literare grecești. … Aceasta este ceea ce vreau să luminez și este ușor să demonstrez că aici și geniul imaginar și impudența în prezentarea pretențiilor sale se află în legătură directă cu ignoranța și lipsa de iubire a adevărului. … Soluția sa este de a diminua metoda istorico-critică, de a certa orice perspectivă estetică care se abate de la a sa și de a atribui o „neînțelegere completă a studiului antichității” epocii în care filologia din Germania, în special prin opera lui Gottfried Hermann și Karl Lachmann, a fost ridicată la o înălțime fără precedent. sugerând că grecii ar fi putut avea probleme, Nietzsche se îndepărta de tradițiile științifice ale epocii sale, care îi priveau pe greci ca pe un popor fericit, poate chiar naiv și simplu. Lucrarea este o rețea de Filologie profesională, perspectivă filosofică și admirație a artei muzicale. Ca lucrare în filologie, a fost aproape imediat respinsă, distrugând practic aspirațiile academice ale lui Nietzsche. Tema muzicală a fost atât de strâns asociată cu Richard Wagner încât a devenit o jenă pentru Nietzsche odată ce el însuși a atins o anumită distanță și independență față de Wagner. Ea reprezintă, deci, prima lucrare filosofică completă, publicată de Nietzsche, una în care se pune o serie de întrebări, se identifică schițat și se răspunde la întrebări.

Marianne Cowan, în introducerea sa în filosofia lui Nietzsche în epoca tragică a grecilor, descrie situația în aceste cuvinte:

Nașterea tragediei a prezentat o viziune a grecilor atât de străină de spiritul vremii și de idealurile erudiției sale, încât a stricat întreaga carieră academică a lui Nietzsche. A provocat broșuri și contra-broșuri care l-au atacat pe motive de bun simț, bursă și sănătate. Pentru o vreme, Nietzsche, pe atunci profesor de filologie clasică la Universitatea din Basel, nu avea studenți în domeniul său. Prelegerile sale au fost sabotate de profesori germani de filosofie care și-au sfătuit studenții să nu se prezinte la cursurile lui Nietzsche. până în 1886, Nietzsche însuși avea rezerve cu privire la lucrare și a publicat o prefață în ediția din 1886 unde a reevaluat unele dintre principalele sale preocupări și idei din text. În acest post-scenariu, Nietzsche s-a referit la Nașterea tragediei drept „o carte imposibilă… scris prost, greoi, jenant, nebun de imagine și confuz de imagine, sentimental, zaharină până la punctul de efeminare, inegal în tempo, fără voința de curățenie logică. Totuși, el a apărat „cartea arogantă și rapsodică” pentru că i-a inspirat pe „colegii rapsodizatori” și pentru că i-a ademenit pe „noi căi secrete și locuri de dans.”

în 1888, în Ecce Homo, Nietzsche a fost din nou pe atac. El apără Nașterea tragediei afirmând: „… este indiferent față de politică— „ne-Germană”, să folosești limbajul prezentului—miroase jignitor Hegelian, iar parfumul cadaveric al lui Schopenhauer se lipește doar de câteva formule. O ‘ idee——antiteza Dionisianului și a Apolinianului-tradusă în metafizic; istoria însăși ca dezvoltare a acestei idei; în tragedie această antiteză este sublimată într-o unitate; sub această perspectivă lucrurile care nu s-au confruntat niciodată înainte sunt brusc juxtapuse, folosite pentru a se ilumina reciproc și înțelese… Opera, de exemplu, și revoluția.- Cele două inovații decisive ale cărții sunt, în primul rând, înțelegerea fenomenului Dionisian în rândul grecilor: pentru prima dată, este oferită o analiză psihologică a acestui fenomen și este considerată o rădăcină a întregii arte grecești. Cealaltă este înțelegerea Socratismului: Socrate este recunoscut pentru prima dată ca un instrument de dezintegrare greacă, ca un tipic D. Raționalitate împotriva instinctului. ‘Raționalitatea’ cu orice preț ca o forță periculoasă care subminează viața!- Tăcere profundă, ostilă despre creștinism în întreaga carte. Aceasta nu este nici Apolliniană, nici Dionisiană; ea neagă toate valorile estetice—singurele valori pe care Nașterea tragediei le recunoaște: este nihilistă în sensul cel mai profund, în timp ce în simbolul Dionisian se atinge limita finală a afirmării. Există o aluzie la preoții creștini ca un ‘tip vicios de pitici’ care sunt ‘subterani’ …”

în titlul romanului său Muntele Magic, Thomas Mann face aluzie la un pasaj din Nașterea tragediei, iar influența operei lui Nietzsche poate fi văzută în personajul romanului Mynheer Peepercorn, care întruchipează”principiul Dionisian”.

în contextul unui studiu critic al „umanismului ateu” al lui Nietzsche, influentul teolog catolic Henri de Lubac a considerat-o „o operă de geniu” și a dedicat mai multe pagini ale studiului său pentru a explica relația dintre gândirea timpurie a lui Nietzsche și creștinism.