Shigella flexneri is een gramnegatieve bacterie die de meest overdraagbare bacteriële dysenterie veroorzaakt, shigellose. Shigellosis veroorzaakt 1,1 miljoen doden en meer dan 164 miljoen gevallen per jaar, met de meerderheid van de gevallen die zich voordoen bij kinderen van ontwikkelingslanden. De pathogenese van S. flexneri is gebaseerd op het vermogen van de bacterie om binnen te dringen en te repliceren in het epitheel van de dikke darm, wat resulteert in ernstige ontsteking en epitheliale vernietiging. De moleculaire mechanismen die S. flexneri gebruikt om de epitheliale barrière te passeren, de immuunrespons van de gastheer te ontwijken en epitheliale cellen binnen te gaan zijn uitgebreid bestudeerd in zowel in vitro als in vivo modellen. Bijgevolg zijn tal van virulentiefactoren die essentieel zijn voor bacteriële invasie, intercellulaire verspreiding en de inductie van ontsteking geïdentificeerd bij S. flexneri. De ontsteking die door de gastheer wordt geproduceerd, is betrokken bij zowel de vernietiging van het epitheel van de dikke darm als bij het beheersen en bevatten van de Shigella-infectie. De humorale reactie van de gastheer op S. flexneri blijkt ook belangrijk te zijn in het beschermen van de gastheer, terwijl de rol van de cellulaire immuunrespons onduidelijk blijft. De immuunrespons van de gastheer op shigellosis is serotype-specifiek en beschermend tegen herinfectie door hetzelfde serotype, waardoor vaccinatie mogelijk is. Sinds de jaren 1940 vaccins voor S. flexneri is met weinig succes ontwikkeld, maar het groeiende begrip van S. flexneri ‘ s pathogenese en de immuunrespons van de gastheer helpt bij het genereren van meer verfijnde vaccinstrategieën. Het huidige onderzoek omvat een verscheidenheid aan vaccintypes, die ondanks verschillen in hun werkzaamheid en veiligheid bij de mens veelbelovende vooruitgang vertegenwoordigen in de ontwikkeling van S. flexneri vaccins.