Steigereiwitten
wat zijn Steigereiwitten?
proteïne scaffolds zijn leden van de signaalcascade stroomafwaarts van receptoren voor het celoppervlak. Steigerproteã NEN helpen de boodschap tussen het celmembraan en de kern sneller doorgeven. Zij doen dit door als docking plaats voor veelvoudige eiwitpartners in de cascade te dienen zodat kunnen zij dichtbij elkaar zijn. Deze nabijheid vermindert de tijd die nodig is voor één eiwit in de cascade om zijn partner te vinden. Sommige eiwitsteigers blijven gelost totdat een bericht van een geactiveerde membraanreceptor hen bereikt, waarna zij door verscheidene proteã nen in de cascade worden gedokt. Andere eiwitsteigers worden gedokt door proteã nen in de cascade nog voordat een geactiveerde membraanreceptor een bericht naar hen verzendt, die de efficiency verhogen waarin de boodschap van receptor aan kern wordt doorgegeven.
GPCR’ s en Steigerproteïnen
g-protein Coupled Receptors (GPCR ‘ s) zijn een grote klasse van celoppervlakteproteïnen die extracellulaire signalen doorgeven aan de kern. Een voorbeeld van een GPCR is de β-adrenergic receptor die het hormoon adrenaline voelt. Zodra geactiveerd door een ligand bij de buitenceloppervlakte, activeren GPCRs hun verwante g-proteã nen die op het binnencelmembraan verblijven. De geactiveerde g-proteã nen glijden dan langs de binnenkant van het celmembraan om een cascade van proteã nen en enzymen te activeren die beurtelings het originele bericht versterken dat door GPCR wordt ontvangen. Steigerproteã nen zijn belangrijke knooppunten van informatie stroomafwaarts van geactiveerde GPCRs. Steigerproteã nen werven stroomafwaartse leden van een signalerende cascade aan het binnencelmembraan zeer snel, of van tevoren, makend het efficiënt voor het bericht om van GPCR aan cytosol te bewegen.
Activeringstoestanden van de Signaalcascade
de complexiteit van intracellulaire signalering is dat de eiwitten in een signaalcascade verschillende activiteitstoestanden hebben (d.w.z. uit, gedeeltelijk actief, volledig actief). Deze staten hangen van conformational veranderingen af die uit interactie met andere proteã nen resulteren. Zij hangen ook van de aanwezigheid of de afwezigheid van delen, zoals fosfaatgroepen, ubiquitingroepen, en calciumionen af. De activeringsstaat van een signalerende proteã ne wordt vaak gebruikt als indicator of een bepaalde weg is geactiveerd. Bijvoorbeeld, worden phosphorylated MEK of ERK vaak geïnterpreteerd als vertegenwoordigend activering van een intracellular signalerende weg stroomafwaarts van een GPCR. Voorts kunnen deze signalerende proteã nen veelvoudige plaatsen van phosphorylation hebben, verschillende combinaties waarvan het niveau van de activiteit of halveringstijd van de proteã ne beà nvloeden. De proteã nen zoals MEK en ERK zijn gekend om dicht bij elkaar op steigerproteã nen te binden. De proteã nen van de capaciteitssteiger om MEK en ERK te binden worden ook geregeld in termen van de activeringsstaat van de steiger, die na post-Vertalende wijziging door toevoeging van chemische delen verandert.
Picking the Right Epitopes for Accurate Information
de eerder genoemde complexiteit van intracellulaire signalering is precies de reden waarom het kiezen van de juiste antilichamen cruciaal is wanneer onderzoekers de toestand van een cel nauwkeurig proberen te bepalen in reactie op extracellulaire stimuli. Elke actieve bouw van een proteã ne of phosphorylation-plaats kan als verschillende epitope dienen die door een antilichaam kan worden gebonden. Aldus, kunnen de antilichamen die worden ontworpen om de aanwezigheid of de afwezigheid van een chemische groep op een signalerende proteã ne te ontdekken onderzoekers een duidelijk beeld geven van welke weg en in welke mate is geactiveerd. Phosphorylated epitopes zijn vaak doelstellingen van immunoblotting en immunolocalization analyses in situ. Aangezien een proteã ne veelvoudige phosphorylation plaatsen kan hebben, elk waarvan de proteã ne verschillend, naast veelvoudige plaatsen voor delen zoals ubiquitination beà nvloedt, is het plukken van de juiste epitopes om te ontdekken een vruchtbare – maar niet trivial – taak.
meerdere epitopen, zowel op hetzelfde eiwit als op verschillende eiwitten, kunnen gelijktijdig of sequentieel worden gedetecteerd op dezelfde vlek of dezelfde cellen. Het is zo belangrijk dat de juiste gastheerspecies voor primaire en secundaire antilichamen met voorbeschouwing worden overwogen. De enige antilichamen van het domein zijn ook nuttig voor deze experimenten, die aan de veelzijdigheid van combinaties van antilichamen toevoegen die in de zelfde analyse kunnen worden gebruikt.
zowel monoklonale als polyclonale antilichamen zijn nuttig bij het opsporen van de toestand van intracellulaire signaalcascades. Onze antilichaam selectie gids maakt het kiezen van de juiste combinatie van antilichamen gemakkelijk. Het houdt rekening met de specimen species, de gastheerspecies, het gewenste niveau van specificiteit, en kruisreactiviteit zorgen, onder andere factoren. De Gids van de antilichaamselectie zal u naar de beste opties voor single-purpose antilichamen of die leiden die u in veelvoudige toepassingen zult gebruiken. De juiste combinatie die antilichamen aan strategische epitopes worden gericht zal duidelijkheid aan de staat van om het even welke intracellular signalerende cascade brengen.