abstrakt

det ribosomala peptidyltransferascentret (PTC) finns i den stora ribosomala subenheten och katalyserar de två huvudsakliga kemiska reaktionerna för proteinsyntes: peptidbindningsbildning och peptidfrisättning. De katalytiska mekanismerna som används och deras hämning av antibiotika har varit i fokus för molekylära och strukturella biologer i årtionden. Med belysningen av atomstrukturer i den stora ribosomala subenheten i början av det nya årtusendet fick dessa frågor en ny nivå av molekylär betydelse. De kristallografiska strukturerna bekräftade övertygande att peptidyltransferas är ett RNA-enzym. Detta placerar ribosomen på listan över naturligt förekommande riboyzmes som överlevde övergången från den pre-biotiska RNA-världen till samtida biologi. Biokemiska, genetiska och strukturella bevis belyser ribosomens roll som en entropisk katalysator som accelererar peptidbindningsbildning främst genom substratpositionering. Samtidigt bör peptidfrisättning starkare bero på kemisk katalys som sannolikt involverar en rRNA-grupp av PTC. PTC kännetecknas av den mest uttalade ackumuleringen av universellt konserverade rRNA-nukleotider i hela ribosomen. Således kom det som en överraskning att de senaste fynden avslöjade en oväntad hög variation i läget för antibiotikabindning till PTC av ribosomer från olika organismer.