detta kapitel diskuterar kortfattat Darwins arternas ursprung och dess följeslagare volymen variationen av djur och växter under domesticering. Det är i den andra stora boken som Darwin tog en bred undersökning av hela variationen och ärftligheten och utvecklade sin Pangenesis, en utvidgad cellteori och en enhetlig genetisk teori som skulle stärka hans evolutionsteori och förklara livets många fenomen. Det väsentliga antagandet om Pangenesis är förekomsten av ärftliga partiklar eller molekyler som kallas gemmules, och deras produktion av celler vid varje utvecklingsstadium. Han antog att förutom den vanliga celldelningen kunde celler också” kasta bort ” många och små gemmules, som kunde självreplikation och vila, diffusion från cell till cell eller cirkulation genom kroppen, modifiering av effekterna av användning och missbruk eller miljöförändringar, förening med växande celler, aggregering i knoppar och bakterieceller och överföring från förälder till avkomma. Genom sin Pangenesis förklarade Darwin inte bara de allmänna fenomenen som hänför sig till arv, variation, utveckling och reproduktion, utan också arv av förvärvade karaktärer, prepotens, grafthybridisering, återgång, regenerering, xenia, telegoni, införlivande, könsbundet arv, arv och icke-arv av stympning och många andra fakta. Darwin kallade Pangenesis sitt ”älskade barn” och trodde fast att det ”kommer att bli sant en dag!”