Crocodylus intermedius är en art av krokodil är mest hotade. Den viktigaste kända populationen av denna art är i Cojedes river system (SRC), Venezuela, ett område under tungt mänskligt tryck. Baserat på nattantal uppskattades befolkningen i Orinoco krokodil i SRC till minst 547 individer (exklusive avkommor). Sektionerna i den mellersta delen av SRC, särskilt mot slutet av ca Aubbio de Agua, visade de högsta befolkningsindexen (7,3 ind/km). Intermediate population index observerades i Cojedes Norte och ca Exceptiono de Agua Norte (2, 2 respektive 4, 4 ind/km), delar av SRC relativt nära viktiga stadscentrum och relativt höga nivåer av livsmiljöförändring och förorening. De lägsta befolkningsindexen (<1, 0 ind/km) observerades i navigerbara delar av SRC långt från stora stadscentrum. Krokodilpopulationen i de norra delarna av SRC dominerades av ungdomar, medan undervuxna och vuxna stod för en betydande del av befolkningen på platser med relativt höga krokodiltätheter.