2015 debuterade Eggers med skräckfilmen Häxan, baserat på sitt eget manus. Filmen hade premiär på Sundance Film Festival 2015 den 27 januari 2015. A24 förvärvade filmen och släppte den teatraliskt den 19 februari 2016. Kritisk mottagning var till stor del positiv och filmen tjänade över 40 miljoner dollar mot en budget på 4 miljoner dollar. Hans uppföljningsfilm, skräckfantasi fyren (2019), också en periodbit, hyllades kritiskt. Eggers regisserade filmen och skrev manuset tillsammans med sin bror Max Eggers.

i juli 2015 rapporterades att Eggers skulle skriva och regissera en nyinspelning av 1922 stumfilm Nosferatu, baserad på Dracula mytologi. Filmen kommer att produceras av Jay Van Hoy och Lars Knudsen för Studio 8. I November 2016 uttryckte Eggers överraskning att Nosferatu-remake skulle bli hans andra film och sa ”det känns fult och blasfemiskt och egomaniskt och äckligt för en filmskapare på min plats att göra ”Nosferatu” nästa. Jag planerade verkligen att vänta ett tag, men det var så ödet skakade ut.”Eggers hade tidigare regisserat sin gymnasieprestation av Nosferatu-pjäsen och anställdes för att regissera en professionell version av pjäsen på grund av sitt arbete. Eggers krediterade detta som händelsen som inspirerade honom att bedriva en karriär inom filmskapande. Filmen har sedan dess satts på is.

Eggers utvecklar för närvarande en” medeltida episk ” film som heter The Northman starring Nicole Kidman, Bj Bisexrk, Willem Dafoe, Anya Taylor-Joy, Alexander Skarsgood och Ethan Hawke och en miniserie baserad på Rasputin liv.