Shigella flexneri är en gramnegativ bakterie som orsakar den mest smittsamma av bakteriella dysenterier, shigellos. Shigellos orsakar 1,1 miljoner dödsfall och över 164 miljoner fall varje år, med de flesta fall som förekommer hos barn i utvecklingsländer. Patogenesen av S. flexneri bygger på bakteriens förmåga att invadera och replikera i kolonepitelet, vilket resulterar i svår inflammation och epitelförstöring. De molekylära mekanismer som används av S. flexneri för att korsa epitelbarriären, undvika värdens immunsvar och komma in i epitelceller har studerats omfattande i både in vitro-och in vivo-modeller. Följaktligen har många virulensfaktorer som är väsentliga för bakteriell invasion, intercellulär spridning och induktion av inflammation identifierats i S. flexneri. Den inflammation som produceras av värden har varit inblandad i både förstörelsen av kolonepitelet och i att kontrollera och innehålla Shigella-infektionen. Värdens humorala svar på S. flexneri verkar också vara viktigt för att skydda värden, medan rollen för det cellulära immunsvaret förblir oklart. Värdens immunsvar mot shigellos är serotypspecifikt och skyddande mot återinfektion av samma serotyp, vilket gör vaccination möjlig. Sedan 1940-talet vacciner för S. flexneri har utvecklats med liten framgång, men den växande förståelsen för S. flexneris patogenes och värdens immunsvar hjälper till att generera mer raffinerade vaccinstrategier. Nuvarande forskning omfattar en mängd olika vaccintyper, som trots skillnader i deras effekt och säkerhet hos människor representerar lovande framsteg inom S. flexneri-vaccinutveckling.