ABSTRACT

het ribosomal peptidyl transferase center (PTC) bevindt zich in de grote ribosomale subeenheid en katalyseert de twee belangrijkste chemische reacties van eiwitsynthese: peptide binding formation en peptide release. De katalytische mechanismen aangewend en hun remming door antibiotica zijn in de nadruk van moleculaire en structurele biologen decennia geweest. Met de opheldering van atomaire structuren van de grote ribosomale subeenheid aan het begin van het nieuwe millennium, kregen deze vragen een nieuw niveau van moleculaire betekenis. De kristallografische structuren bevestigden dwingend dat peptidyltransferase een RNA-enzym is. Dit plaatst het ribosoom op de lijst van natuurlijk-het voorkomen riboyzmes dat de overgang van de pre-biotic wereld van RNA aan hedendaagse biologie overleefde. Het biochemische, genetische en structurele bewijsmateriaal benadrukt de rol van het ribosoom als entropic katalysator die peptide bandvorming hoofdzakelijk door substraatpositionering versnelt. Tegelijkertijd, zou de peptide versie sterker van chemische katalyse moeten afhangen waarschijnlijk die een rRNA-groep van PTC impliceren. PTC wordt gekenmerkt door de meest uitgesproken accumulatie van universeel geconserveerde rRNA-nucleotiden in het gehele ribosoom. Aldus, kwam het als een verrassing dat de recente bevindingen een onverwacht hoog niveau van variatie in de wijze van antibiotische band aan PTC van ribosomen van verschillende organismen openbaarden.