in 1868 werd de middeleeuwse stad Edo, de zetel van de Tokugawa-regering, omgedoopt tot Tokio en werden de kantoren van de prefectuur Tokio (- fu) geopend. De oppervlakte van de prefectuur Tokio was aanvankelijk beperkt tot de Voormalige Edo-stad, maar groeide snel om vergelijkbaar te zijn met de huidige Tokyo-metropool. In 1878, de Meiji regering reorganisatie van lokale overheden onderverdeeld prefecturen in graafschappen of districten (gun, verder onderverdeeld in steden en dorpen, later gereorganiseerd vergelijkbaar met Pruisische districten) en districten of wijken (ku) die waren in gewone prefecturen steden als geheel, bijvoorbeeld de huidige Hiroshima stad (-shi) was toen Hiroshima-ku; De drie grote steden van Tokio, Osaka en Kyoto waren elk onderverdeeld in verschillende dergelijke wijken. In de prefectuur Tokio werden 15 wijken (hieronder vermeld) en zes provincies/districten gecreëerd.in 1888 creëerde de centrale overheid het wettelijke kader voor het huidige systeem van steden (shi) dat een aantal fundamentele lokale autonomie rechten verleende – met enkele overeenkomsten met Pruisen ‘ s systeem van lokaal zelfbestuur als Meiji government advisor Albert Mosse sterk de organisatie van het lokale bestuur beïnvloed. Maar onder een speciale keizerlijke regelgeving, Tokyo City, zoals Kyoto City en Osaka City, aanvankelijk had geen aparte burgemeester; in plaats daarvan, de (benoemde) gouverneur van Tokyo Prefecture diende als burgemeester van Tokyo City. De Tokyo city council / assembly (Tōkyō-shikai) werd voor het eerst verkozen in mei 1889. Elke afdeling behield ook zijn eigen vergadering. Stad en prefectuur werden gescheiden in 1898., en de regering begon een aparte burgemeester van Tokyo City te benoemen in 1898, maar behield ward-Level wetgeving, die tot op de dag van vandaag in de speciale wijk systeem. Vanaf 1926 werd de burgemeester gekozen door de gemeenteraad uit eigen gelederen. Het stadhuis van Tokio was gevestigd in het district Yūrakuchō, op een plek die nu bezet wordt door het Tokyo International Forum.Tokio werd de op een na grootste stad ter wereld (met 4,9 miljoen inwoners) nadat het in juli 1932 een aantal afgelegen districten opnam, waardoor de stad in totaal 35 wijken telde.in 1943 werd de stad opgeheven en samengevoegd met de prefectuur Tokio tot de Tokyo Metropolitan Government, die functioneel deel uitmaakte van de centrale overheid van Japan. Dit systeem bleef bestaan tot 1947, toen de huidige structuur van de Tokyo Metropolitan Government werd gevormd.