hij richtte in 1984 de Bay Area Laboratory Co-operative (BALCO) op, een sportvoedingscentrum dat eerst gevestigd was in Millbrae, Californië en later verhuisde naar Burlingame, Californië. De Verenigde Staten Anti-Doping Agency (USADA) zegt dat hij de verboden steroïde tetrahydrogestrinone (THG) ontwikkeld met de hulp van bodybuilding chemicus Patrick Arnold. Op grond van een deal gesloten met aanklagers, ging hij schuldig pleiten in juli 2005 aan een aanklacht van samenzwering om steroïden te distribueren en een tweede aanklacht van het witwassen van een deel van een cheque. Hij werd in oktober veroordeeld tot vier maanden doorbrengen in de federale Taft Correctional Institution in Taft, Californië, en nog eens vier op huisarrest.in December 2004 nam hij deel aan een interview met Martin Bashir op ABC ’s 20/20-programma, waar hij toegaf dopingprogramma’ s te hebben uitgevoerd, die Olympische records hebben gebroken, en onthulde dat: “De hele geschiedenis van de games is gewoon vol corruptie, doofpot, prestatieverhogend drugsgebruik.in het interview betrok hij onder andere vijfvoudig Olympisch gouden medaillewinnaar Marion Jones en haar partner Tim Montgomery, Kelli White (die later toegaf dat hij prestatiebevorderende drugs gebruikte), de Britse atleet Dwain Chambers en NFL-speler Bill Romanowski.op 21 December 2006 meldde Yahoo Sports dat een van Conte ‘ s eerste advocaten, Troy Ellerman, het doelwit was van de FBI als een mogelijke bron van lekken naar de media tijdens de Barry Bonds probe. Op 14 februari 2007 pleitte Ellerman schuldig aan het lekken van een getuigenis van de grand jury. Er werd ook gemeld dat FBI-agenten een extra bron van lekken waren.in Mei 2007 claimde Conte opnieuw supplementen te verstrekken aan Dwayne Chambers, die de atletiek verliet om in de NFL Europa league te spelen voor de Hamburg Sea Devils voordat hij terugkeerde naar de atletiek in 2008. Volgens Conte zijn deze voedingssupplementen, verstrekt via zijn bedrijf Scientific Nutrition for Advanced Conditioning, volkomen legaal.op 13 December 2007 verscheen Conte op CNN voordat the Mitchell report officieel werd uitgebracht.