Aspergillus a Candida spp jsou nejčastěji izolované houby u pacientů s otomykózu. Diagnóza otitis externa závisí na anamnéze pacienta, otoskopickém vyšetření pod mikroskopickou kontrolou a zobrazovacích studiích. Přímé přípravy vzorků, zejména s optické zjasňovače, mycologic kultury, a histologické vyšetření, je velmi důležité, a důrazně doporučuje pro správnou diagnózu. Pacienti s neinvazivním plísňovým otitis externa by měli být léčeni intenzivním débridementem a čištěním a topickými antimykotiky. Lokální antimykotika, jako je například klotrimazol, mikonazol, bifonazol, ciclopiroxolamine, a tolnaftate, jsou potenciálně bezpečné možnosti pro léčbu otomykózu, zejména u pacientů s perforované bubínku. Ústní triazol léky, itrakonazol, vorikonazol a posakonazol jsou účinné proti Candida a Aspergillus, s dobrou pronikání kostí a centrálního nervového systému. Tyto léky jsou nezbytné při léčbě pacientů s maligním plísňovým otitis externa komplikovaným mastoiditidou a meningitidou.