Fosfolipázy A2

( 140K )

Fosfolipázy A2 je jedním z nejvíce prozkoumaných membránových proteinů, které hydrolyzuje fosfolipidy v sn-2 pozici formě mastných kyselin a lysophospholipid produkty. Jedná se o malé proteiny a o 3 – D strukturách je známo, že mají vysoké rozlišení pro několik druhů. Fosfolipázy A2 proteiny jsou vysoké farmaceutické obavy, protože oni jsou zodpovědní za uvolnění kyseliny arachidonové z membrán, a protože následné přeměny tohoto mastných kyselin na leukotrieny a prostaglandiny je součástí zánětlivé odpovědi.

enzym také vykazuje velmi zajímavé interakce s membránou, na které se váže. Nějakým způsobem se aktivuje, když interaguje s agregovanými formami substrátu, jako jsou micely nebo dvojvrstvy. Předpokládá se, že elektrostatické a hydrofobní interakce se podílejí na vazbě enzymu na membránu. O komplexní struktuře enzym-membrána je známo jen velmi málo a proč enzym reaguje mnohem účinněji, jakmile váže své substráty v agregované formě.

zvláště nás zajímá studium interakce fosfolipázy A2 s buněčnou membránou prostřednictvím molekulárního modelování a molekulární dynamiky. Zajímavé otázky jsou: mechanismus povrchové aktivace; interakce PLA2 se záporně nabitými lipidy; a konformační a energetické vlastnosti lipidů v rozhraní protein-membrána. Naše simulace naznačují, že desolvace 2-3 lipidových molekul nastává, když je pla pevně spojena s membránou, a mohla by usnadnit vazbu substrátu a zvýšit reakční rychlost. Také jsme vypočítali potenciální povrch proteinu na povrchu membrány.

používáme metodu řízené molekulární dynamiky ke zkoumání působení lidské synoviální proteinové fosfolipázy A2 (PLA2) na rozhraní lipidové vody. PLA2 se váže na membránový povrch v scooting režimu a katalyzuje hydrolytické reakce sn-2 esterové vazby fosfolipidů, která vede následně k destrukci membrány povrchu. Předpokládá se, že skutečná katalýza je initována odsáváním fosfolipidu z povrchu membrány do H ydrofobního kanálu PLA2, kde probíhá reakce. Mechanismus tohoto sání je málo pochopen a předpokládá se, že je způsoben destabilizací n polární fosfolipidové skupiny hydrofobním prostředím vázacího ing kanálu PLA2. Zkoumáme proces vytlačování fosfolipidu pro dva režimy vazby PLA2 na povrch membrány, tj. pevně a L oosely vázané režimy. Naše hypotéza je, že před vytlačováním fosfolipidu, PLA2 musí tvořit pevně vázaný komplex, zatímco volně vázaný komplex by neměl vést k katalýze.

Vyšetřovatelé

• Sergej Izrailev
• Feng Zhou
• Klaus Schulten

Publikace

-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN“ „http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd“>Publications Databáze Molekulární dynamiky studium aktivace fosfolipázy A2 na povrchu membrány.Feng Zhou a Klaus Schulten. Proteiny: struktura, funkce a genetika, 25: 12-27, 1996.