Lešení proteiny
co jsou lešení proteiny?
proteinové lešení jsou členy signalizační kaskády za receptory buněčného povrchu. Proteiny lešení pomáhají přenášet zprávu mezi buněčnou membránou a jádrem rychleji. Dělají to tím, že slouží jako dokovací místo pro více proteinových partnerů v kaskádě, aby mohli být blízko sebe. Tato blízkost zkracuje čas potřebný k tomu, aby jeden protein v kaskádě našel svého partnera. Některé proteinové lešení zůstávají vyloženy, dokud se k nim nedostane zpráva z aktivovaného membránového receptoru, po které jsou ukotveny několika proteiny v kaskádě. Jiné proteinové lešení jsou ukotveny tím, bílkoviny v kaskádě ještě předtím, než aktivní membránový receptor pošle jim zprávu, zvýšení účinnosti, ve kterém je zpráva předána z receptoru do jádra.
GPCRs a Lešení Proteiny
G-protein Vázané Receptory (GPCRs) jsou velké třídy buněčné povrchové proteiny, které relé extracelulární signály do jádra. Příkladem GPCR je β-adrenergní receptor, který snímá hormon adrenalin. Po aktivaci ligandem na vnějším povrchu buněk GPCR aktivují své příbuzné G-proteiny, které jsou umístěny na vnitřní buněčné membráně. Aktivované G-proteiny se pak posouvají podél vnitřku buněčné membrány a aktivují kaskádu proteinů a enzymů, které zase zesilují původní zprávu přijatou GPCR. Lešení proteiny jsou klíčové rozbočovače informací po proudu aktivovaných GPCRs. Lešení proteiny nábor následný členy signalizační kaskády na vnitřní buněčnou membránou velmi rychle, nebo dopředu, což je efektivní pro zprávu přesunout z GPCR do cytosolu.
Aktivace Státy Signalizační Kaskády
složitost intracelulární signalizace je, že proteiny signalizační kaskády mají různé státy z činnosti (tj. vypnuto, částečně aktivní, plně aktivní). Tyto stavy závisí na konformačních změnách, které jsou výsledkem interakcí s jinými proteiny. Závisí také na přítomnosti nebo nepřítomnosti skupin, jako jsou fosfátové skupiny, ubikvitinové skupiny a ionty vápníku. Aktivační stav signálního proteinu se často používá jako indikátor toho, zda byla aktivována určitá cesta. Například fosforylovaný MEK nebo ERK je často interpretován jako představující aktivaci intracelulární signální dráhy za GPCR. Kromě toho mohou mít tyto signální proteiny více míst fosforylace, jejichž různé kombinace ovlivňují úroveň aktivity nebo poločasu proteinu. Je známo, že proteiny, jako jsou MEK a ERK, se váží blízko sebe na proteiny lešení. Schopnost proteinů lešení vázat MEK a ERK je také regulována z hlediska aktivačního stavu lešení, který se mění po posttranslační modifikaci přidáním chemických skupin.
Výběrem Správné Epitopy pro Přesné Informace
výše uvedená složitost intracelulární signalizace je přesně důvod, proč výběr správné protilátky, je velmi důležité, když vědci se snaží přesně určit stav buňky v odpovědi na extracelulární stimuly. Každá aktivní konformace proteinového nebo fosforylačního místa může sloužit jako jiný epitop, který může být vázán protilátkou. Tak, protilátky, které jsou navrženy tak, aby detekovat přítomnost nebo nepřítomnost chemické látky na signální protein může dát vědcům jasný obrázek o tom, co cesta byla aktivována a do jaké míry. Fosforylované epitopy jsou často terčem imunoblotačních a in situ imunologických testů. Protože protein může mít více fosforylace lokalit, z nichž každá ovlivňuje protein jinak, kromě toho na více míst pro skupiny, jako jsou ubikvitinace, výběrem správné epitopy pro detekci je plodný – ale netriviální úkol.
Více epitopů, ať už na stejném proteinu nebo různých proteinech, může být současně nebo postupně detekováno na stejné skvrně nebo stejných buňkách. Je proto důležité, aby byly správné hostitelské druhy pro primární a sekundární protilátky zvažovány s rozmyslem. Pro tyto experimenty jsou také užitečné protilátky s jednou doménou, které zvyšují univerzálnost kombinací protilátek, které lze použít ve stejném testu.
monoklonální i polyklonální protilátky jsou užitečné při detekci stavu intracelulárních signalizačních kaskád. Náš průvodce výběrem protilátek usnadňuje výběr správné kombinace protilátek. Bere v úvahu druh vzorku, hostitelský druh, požadovanou úroveň specifičnosti, a obavy z křížové reaktivity, mimo jiné faktory. Průvodce výběrem protilátek vás dovede k nejlepším možnostem jednoúčelových protilátek nebo těch, které budete používat ve více aplikacích. Správná kombinace protilátek zaměřených na strategické epitopy přinese jasnost stavu jakékoli intracelulární signalizační kaskády.