Oncomine
Oncomine je cílený test pro identifikaci klinicky významných somatických mutací, včetně jednonukleotidových variant (SNVs), inserce a delece (Indels), genové fůze a zkopírujte číslo změny (CNAs) z DNA a RNA 143 rakovinou souvisejících genů (>2,500 amplikony) v pevných nádorů, pomocí cílené příští generace sekvenování (NGS). Geny vyslýchán v testu jsou rozděleny do kategorií podle genomické změny do 73 hot spot geny (s SNVs a Indels), včetně 49 genů s ohniskovou CNAs, jako ERBB2, a 23 genů se známou fúze jako je ALK a ROS1 u NSCLC. Test také obsahuje čtyři páry 5′, 3′ výraz nerovnováhy, testy pro ALK, ROS1, RET a NTRK1. Kromě toho test poskytuje plné pokrytí 26 nádorových supresorových genů.
komplexní panel Oncomine je schopen detekovat fúze NTRK1, NTRK2 a NTRK3. Pacienti s tímto typem fúze mohou být způsobilí pro larotrektinib, nedávno schválenou léčbu FDA pro nádory fúze kinázy tropomyosinového receptoru (TRK).
Oncomine List
Oncomine FAQ
Exemplář Požadavky
- Formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) exempláře,
- Jeden H&E Posuňte a 15-20 Neobarvené části jsou nutné
- minimální množství nádorové celularity přijatelné je 20%
- Pevné Aspirace tenkou Jehlou (FNA) vzorku
- Jeden H&E Posuňte a 15-20 Neposkvrněný oddíly z bloku jsou nutné
- minimální množství nádorové celularity přijatelné je 20%
- CytoLyt Řešení
- Buňky suspendované v CytoLyt nebo v roztoku PreservCyt
- Zachována při pokojové teplotě ne déle než 8 dnů
Objednání Testu
Oncomine Komplexní Mutace Panel je k dispozici v Epické a může být nařízeno Onkolog. Patolog nebo Cytopatolog může také objednat test přímo přes CoPath.
Upozornění
Oncomine Komplexní Test byl vyvinut a jeho výkonnostních charakteristik bylo stanoveno podle Klinické Genomika Laboratoř, Englander Institute for Precision Medicine/Oddělení Patologie a Laboratorní Medicíny na Weill Cornell Medicína/New York-Presbyterian Hospital; a schválen New York-Ministerstvo Zdravotnictví (NYS-DOH). Tato metoda nebyla schválena Úřadem pro kontrolu potravin a léčiv (FDA). FDA zjistila, že takové povolení nebo schválení není nutné.
varianty nejistého původu (zárodečná linie versus somatický původ) nelze v tomto testu jednoznačně určit, takže změny zárodečné linie nejsou hlášeny. Pokud existuje podezření na možnou patogenní zárodečnou mutaci (zděděnou), doporučuje se v poznámce poradenství genetickým poradcem certifikovaným radou.