Shigella flexneri je gram-negativní bakterie, která způsobuje nejvíce nakažlivé bakteriální úplavici, úplavice. Úplavice příčiny 1,1 milionu úmrtí a více než 164 milionů případů ročně, přičemž většina případů vyskytujících se u dětí z rozvojových zemí. Patogeneze s. flexneri je založen na schopnosti bakterií napadnout a replikovat se v epitelu tlustého střeva, což má za následek těžký zánět a destrukci epitelu. Molekulární mechanismy, S. flexneri, aby přes epiteliální bariéru, vyhnout hostitele imunitní reakci a vstupuje epiteliální buňky mají intenzivně studován in vitro a in vivo modelů. V důsledku toho byly u s.flexneri identifikovány četné faktory virulence nezbytné pro bakteriální invazi, mezibuněčné šíření a indukci zánětu. Zánět vyvolaný hostitelem se podílí jak na destrukci epitelu tlustého střeva, tak na kontrole a obsahování infekce Shigella. Humorální odpověď hostitele na S. flexneri se také jeví jako důležitá při ochraně hostitele, zatímco úloha buněčné imunitní odpovědi zůstává nejasná. Hostitele imunitní reakci na shigellosis je sérotyp-specifické a chrání před reinfekcí stejným sérotypem, takže očkování možné. Od roku 1940 vakcíny pro S. flexneri byly vyvinuty s malým úspěchem, nicméně, rostoucí porozumění S. flexneri je patogeneze a hostitele imunitní reakce je pomoc při vytváření více rafinované očkovací strategie. Současný výzkum zahrnuje celou řadu typů vakcín, které navzdory rozdílům v jejich účinnosti a bezpečnosti u lidí představují slibný pokrok ve vývoji vakcíny s.flexneri.