Swan Ostrovy byly objeveny kryštofem Kolumbem v roce 1502 a pojmenoval Islas de las Pozas. V 18. Století, byly přejmenovány na Swan Ostrovy, po Captain Swan, kapitán Cygnet, kterou piráti zajali a donutili se k nim přidat.

Američtí podnikatelé začali vyvážet hnojivo jako hnojivo v 1840s. American-owned, New York-Město, se sídlem „Atlantiku a Pacifiku Guano Společnost“ byla založena v roce 1840 a začali vyvážet hnojivo, na základě guano shromážděné na Swan Ostrovy. V roce 1856 si Spojené státy zřejmě nárokovaly ostrovy. V dubnu 1857, John Valentine Bílé tvrdil ostrovy, na základě Guano Islands Act; o rok později, on se přenesl zájem o tyto ostrovy Charles Sterns, Joseph W. Fabens, a Duff Green. Pánové Sterns, Fabens, a Zelené začleněna Atlantiku a Pacifiku Guano Společnost, která vydala 50.000 akcií za cenu $100 každý o celkové kapitalizaci $5,000,000 v roce 1858. Společnost dokonce vydala měnu podepsanou Williamem h. Whitfieldem v nominálních hodnotách 25 centů, 50 centů a jednoho dolaru 1. Června 1867, aby usnadnila obchod na ostrovech.

následně ostrovy koupila chemická společnost, která se však dostala do insolvence. Kapitán Alonzo Adams se tam plavil v roce 1893 a zmocnil se ostrovů; v roce 1904 přidělil vlastnictví obchodní společnosti Swan Island. To, že firma si pronajala část Velké Swan Island United Fruit Company, které rostly kokosové palmy a nastavte bezdrátové rádiové retranslační stanice pro obsluhu jejich Caribbean fleet, ale nakonec od nájemní smlouvy. Obchodní společnost Swan Island poskytla údaje o sledování hurikánů v letech 1928 až 1932. Americký meteorologický úřad obsluhoval hurikánovou meteorologickou stanici na Great Swan od roku 1938, ale zaměstnával ji pouze během období hurikánů.

během druhé světové války US Navy I US Weather Bureau rozmístily personál na ostrově. Na konci 40. let až do roku 1949 se Swan Island stal karanténní stanicí amerického ministerstva zemědělství pro dovoz hovězího masa. V roce 1914, to, co nyní je Národní Meteorologická Služba (NWS), a později Federální Letecký Úřad (FAA) nastavení meteorologické a komunikační aktiv na Labuť na podporu leteckých služeb a hurikán-predikce aktivity. FAA opustil Swan Island v 1960, opouštět NWS veškerý majetek a odpovědnosti.

Honduras tvrdil, tyto ostrovy od roku 1923, tvrdí, že, protože Kolumbus objevil ostrovy, zatímco plachtění pro Španělsko, které by měly být vlastněny nejbližší španělsky mluvící země. Jak Spojené Státy a Hondurasu prohlásil Swan Islands do Spojených Států klesl jeho tvrzení základě Guano Islands Act. Smlouva byla podepsána 22. listopadu 1971 A Honduras nabyl účinnosti 1. září 1972. Vlastnictví ostrova bylo dlouho ve sporu. Rodina Sumner Smith si vždy udržovala své vlastnictví a, zřejmě, měl nějaké postavení v U.S.soudy. Nicméně, americká vláda se rozhodla opustit svůj nárok navzdory tomuto postavení (ref. D S Plattem a kol., NOAA-NWS). Ostrovy získaly proslulost na počátku šedesátých let z činnosti rádia Swan, které začalo vysílat v květnu 1960 během přípravy a později vedení invaze na Kubu v Zátoce Sviní. Stanice byla z ostrovů odstraněna koncem šedesátých let, její hlavní vysílač byl poté převeden pro použití ve válce ve Vietnamu.

v roce 1965, Bellaire, Texas, policie vyslýchala bývalého studenta střední školy Bellaire o jeho roli v dospívající „armádě“ věnované osvobození „utlačovaných zemí“, hlásil Houston Chronicle. Skupina, volal Kononiers, existoval asi pět let, student řekl novinám, a byl vyzbrojen řadou vloupání do skladu Deep River Armory. Zbraně byly převezeny do oblasti nádrže Addicks, kde se cvičili pro boj. Mladíci cvičili na „operaci osvobození Labutí Ostrov“ u Hondurasu.

V roce 1987, Los Angeles Times, že CIA a další Americké vládní agentury měl tajné výcvikové zařízení na Labutí Ostrov pro Nikaragujské Contras. V roce 1989 prohlásil prezident Hondurasu Rafael Leonardo Callejas ostrov za chráněné útočiště pro volně žijící živočichy.

v říjnu 1998 se hurikán Mitch pohyboval oblastí s větry 290 km / h (180 mph).

v roce 2001 společnost Swan Island Development, LLC z Brooksville na Floridě oznámila plány na rozvoj Labutí ostrovy do roku 2010 ve spolupráci s vládou Hondurasu. Představovaly se luxusní nemovitosti a hotely v hodnotě pěti miliard dolarů s hlavním městem jménem Cygnet. V roce 2004 společnost Swan Island Development také oznámila plány na zřízení výzkumného centra lidských kmenových buněk. Od roku 2021 k žádnému z nich nedošlo.