Zrození tragédie bylo rozzlobeně kritizováno mnoha uznávanými profesionálními učenci řecké literatury. Zvláště vehementní byl filolog Ulrich von Wilamowitz-Moellendorff, který Nietzscheho dílo odsoudil jako slipshod a zavádějící. Výzvy Nietzsche, Erwin Rohde—přítele, který napsal příznivou recenzi, která vyvolala první hanlivé diskuse nad knihou—reagoval tím, že vystaví Wilamowitz-Moellendorf je nepřesné citace z Nietzscheho práci. Richard Wagner také vydal odpověď na Wilamowitz-Moellendorfovu kritiku, ale jeho akce sloužila pouze k charakterizaci Nietzscheho jako skladatelova lokaje.

ve svém vypovězení zrodu tragédie Wilamowitz říká:

Herr N … je také profesorem klasické filologie; zabývá se řadou velmi důležitých otázek řecké literární historie. … To je to, co chci osvětlit, a to je snadné dokázat, že zde také imaginární génius a drzost v prezentaci jeho tvrzení je v přímém vztahu k jeho nevědomosti a nedostatku lásky pravdy. … Jeho řešením je snižovat historicko-kritické metody, nadávat jakýkoliv estetický pohled, který se odchyluje od jeho vlastní, a připisovat „nedorozumění studie starověku“, do věku, v němž filologie v Německu, a to zejména prostřednictvím práce Gottfried Hermann a Karl Lehman, byla zvýšena na bezprecedentní výšky.

když Nietzsche naznačoval, že Řekové mohli mít problémy, odklonil se od vědeckých tradic svého věku, které považovaly řeky za šťastné, možná i naivní a prosté lidi. Práce je sítí profesionální filologie, filozofického vhledu a obdivu k hudebnímu umění. Jako dílo ve filologii bylo téměř okamžitě odmítnuto a prakticky zničilo Nietzscheho akademické aspirace. Hudební téma bylo tak úzce spojeno s Richardem Wagnerem, že se pro Nietzscheho stalo rozpaky, jakmile sám dosáhl určité vzdálenosti a nezávislosti od Wagnera. Stojí, pak, jako Nietzscheho první kompletní, publikovaná filozofická práce, ten, ve kterém je položena řada otázek, útržkovitě identifikováno, a pochybně odpověděl.

Marianne Cowan, v jejím úvodu Nietzsche Filosofie v Tragickém Věku Řeků, popisuje situaci těmito slovy:

Zrození Tragédie představila výhled Řekové tak cizí duchu doby a ideálů jeho stipendium, které je zkažené Nietzscheho celé akademické kariéře. Vyvolalo to letáky a proti-pamflety, které na něj útočily na základě zdravého rozumu, vzdělanosti a zdravého rozumu. Nietzsche, tehdy profesor klasické filologie na basilejské univerzitě, na nějaký čas neměl ve svém oboru žádné studenty. Jeho přednášky sabotovali němečtí profesoři filozofie, kteří radili svým studentům, aby se na Nietzscheho kurzy neobjevovali.

Od Roku 1886 Nietzsche sám měl výhrady k práci a publikoval předmluva v roce 1886 edition, kde re-hodnotí některé z jeho hlavních obav a myšlenek v textu. V tomto post-skriptu, Nietzsche odkazoval se na narození tragédie jako “ nemožná kniha… špatně napsané, nudné, trapné, image-mad a image-zmatený, sentimentální, sacharin k bodu zženštilost, nerovnoměrné tempo, bez vůle logické čistoty.“Přesto obhajoval“ arogantní a rapsodickou knihu „za inspiraci“ kolegy rapsodizéry “ a za to, že je lákal na „nové tajné cesty a taneční místa.“

v roce 1888 se v Ecce Homo Nietzsche vrátil k útoku. On hájí „Zrození Tragédie“, když uvádí: „…To je lhostejný k politice,—’un-němčina,‘ použít jazyk, který je v současné době—voní to urážlivě Hegelovy, a mrtvolný parfém Schopenhauer se lepí pouze na několika vzorcích. „Myšlenka— – protiklad Dionysian a Apollinian-přeložena do metafyziky; dějiny jako vývoj tento „nápad“; v tragédii se tento protiklad je sublimuje do jednoty; podle tohoto pohledu věci, které nikdy předtím tváří v tvář sobě najednou vedle sebe, slouží k osvětlení navzájem, a pochopil… Například Opera a revoluce.— Dva rozhodující inovace knihy jsou, za prvé, jeho pochopení Dionýsovské jev mezi Řeky: pro první čas, psychologickou analýzu tohoto jevu se nabízí, a je považován za jeden kořen celého řeckého umění. Druhým je pochopení Sokratismu: Sokrates je poprvé uznáván jako nástroj řeckého rozpadu, jako typický décadent. „Racionalita“ proti instinktu. „Racionalita“ za každou cenu jako nebezpečná síla, která podkopává život!- Hluboké, nepřátelské ticho o křesťanství v celé knize. To není ani Apollinian ani Dionýsovské; to neguje všechny estetické hodnoty—pouze hodnoty, které ‚Zrození Tragédie se pozná: je nihilistický v nejhlubší smysl, zatímco v Dionýsovské symbol konečný limit potvrzení je dosaženo. Existuje jedna narážka na křesťanské kněze jako na „zlý druh trpaslíků“, kteří jsou „podzemní“…“

V názvu jeho románu Kouzelný vrch Thomas Mann zmiňuje pasáž z „Zrození Tragédie“, a vliv Nietzscheho práce může být viděn v románu je postava Mynheer Peepercorn, který ztělesňuje „Dionýské princip“.

V souvislosti s kritickou studii Nietzscheho „ateistického humanismu“, vlivný Katolický teolog Henri de Lubac považoval za „dílo génia“, a věnoval několik stránek z jeho studie vysvětlete vztah mezi Nietzscheho rané myšlení a Křesťanství.