Crocodylus intermedius er en art af krokodille, der er mest truet. Den mest kendte population af denne art er i Cojedes river system (SRC), et område under tungt menneskeligt pres. Baseret på nattællinger blev befolkningen i Orinoco-krokodillen i SRC estimeret til mindst 547 individer (eksklusive afkom). Sektioner i den midterste del af SRC, især mod slutningen af ca Kurro de Agua, viste de højeste befolkningsindekser (7,3 ind/km). Mellemliggende populationsindekser blev observeret i Cojedes Norte og ca largo de Agua Norte (henholdsvis 2,2 og 4,4 ind/km), sektioner af SRC relativt tæt på vigtige bycentre og relativt høje niveauer af habitatændring og forurening. De laveste befolkningsindekser (<1.0 ind/km) blev observeret i navigerbare dele af SRC langt fra store bycentre. Krokodillepopulationen i de nordlige dele af SRC var domineret af unge, mens undervoksne og voksne tegnede sig for en betydelig del af befolkningen på steder med relativt høje krokodilletætheder.